恭喜北京元码医学检验实验室有限公司王博获国家专利权
买专利卖专利找龙图腾,真高效! 查专利查商标用IPTOP,全免费!专利年费监控用IP管家,真方便!
龙图腾网恭喜北京元码医学检验实验室有限公司申请的专利一种微卫星不稳定性的检测方法和装置获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114664380B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-03-07发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210505751.3,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种微卫星不稳定性的检测方法和装置是由王博;杨家亮;郎继东;田埂设计研发完成,并于2022-05-10向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种微卫星不稳定性的检测方法和装置在说明书摘要公布了:本发明公开了一种微卫星不稳定性的检测方法和装置,涉及生物信息技术领域。本发明通过获取待测样本微卫星不稳定性的标志物的重复单元及其左右两端的序列,并将其整理为正则表达式,基于每个标志物的正则表达式对待测样本二代测序进行针对性的提取、筛选和判断,能够有效快速地完成对待测样本微卫星不稳定性的检测,且无需调参或仅需要少量样本作为调参基准,即可确定MSI状态,从而降低实验、测序以及分析成本,具有推广价值。
本发明授权一种微卫星不稳定性的检测方法和装置在权利要求书中公布了:1.一种微卫星不稳定性的检测方法,其特征在于,其包括以下步骤:获取待测样本中每个生物标志物的正则表达式;其中,所述生物标志物为微卫星不稳定性的标志物,且个数≥2,所述正则表达式为匹配以左侧翼区开头,中间为重复单元,以右侧翼区结尾的序列;所述重复单元为生物标志物对应的重复区域中的一个或多个碱基,所述左侧翼区和所述右侧翼区分别为所述重复区域两侧4~5个碱基;提取数据并获取每个生物标志物对应的直方图:针对每个生物标志物,提取待测样本中含有生物标志物对应正则表达式的二代测序数据,并对每种长度的重复单元进行分布计数,按照每种长度的重复单元的个数从小到大进行排列,将排列结果转化为每个生物标志物对应的直方图;判断每个生物标志物的稳定性:对比正常组织的数据,获取待测样本在每个生物标志物对应的直方图中的峰个数和峰位移,若待测样本和正常组织的峰个数具有差异,则判断为生物标志物不稳定;若峰个数一致但待测样本相对正常的对照样本的峰位移碱基数大于1bp,则判读为生物标志物不稳定;其他情况均判读为生物标志物稳定;判读待测样本的MSI状态:若>30%的生物标志物不稳定,则判读为待测样本为MSI-H型,其他情况则认定为是MSS型;所述生物标志物为Bat25、Bat26、Mono27、NR21、NR24和NR27;Bat25的正则表达式包括:TTTGAT+GAGAA和TTCTCA+TCAAA中的至少一种;Bat26的正则表达式包括:CAGGTA+GGGTT和AACCCT+ACCTG中的至少一种;Mono27的正则表达式包括:CAGGAT+GAGGC和GCCTCA+TCCTG中的至少一种;NR21的正则表达式包括:TTGCTA+GGCCA和TGGCCT+AGCAA中的至少一种;NR24的正则表达式包括:TCCTAT+GTGAG和CTCACA+TAGGA中的至少一种;NR27的正则表达式包括:CTGGTA+GCCAC和GTGGCT+ACCAG中的至少一种。
如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人北京元码医学检验实验室有限公司,其通讯地址为:100000 北京市朝阳区广顺北大街5号院内32号4030;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息,力求客观、公正,但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解,仅供参考使用,不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。