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恭喜中国石油大学(华东)李振获国家专利权

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龙图腾网恭喜中国石油大学(华东)申请的专利一种用于研究磷脂结构对生物膜分裂影响的分子模拟方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119170118B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-03-11发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411666631.7,技术领域涉及:G16C10/00;该发明授权一种用于研究磷脂结构对生物膜分裂影响的分子模拟方法是由李振;彭润宇;张军;燕友果;王晓设计研发完成,并于2024-11-21向国家知识产权局提交的专利申请。

一种用于研究磷脂结构对生物膜分裂影响的分子模拟方法在说明书摘要公布了:本发明提供了一种用于研究磷脂结构对生物膜分裂影响的分子模拟方法,该方法运用了MD(MolecularDynamics)模拟方法对膜管系统进行建模,精确构建了不同磷脂成分的膜管分裂模型,探明了膜分裂的微观动态过程,系统剖析了不同磷脂结构对分裂过程的微观作用机理。该发明有助于从分子尺度上阐释磷脂结构与分裂路径选择的导向关系,可深化现今针对磷脂结构的理论研究。该计算模拟方法的实施还将有助于解释磷脂结构如何调控分裂过程,为深入理解磷脂结构多样性和生物膜的特异性功能奠定理论基础,对帕金森等疾病研究和机理探索提供研究方向。

本发明授权一种用于研究磷脂结构对生物膜分裂影响的分子模拟方法在权利要求书中公布了:1.一种用于研究磷脂结构对生物膜分裂影响的分子模拟方法,其特征在于:该方法包括如下步骤:(1)构建不同结构磷脂成分的膜管分裂模型:按照头基、尾链长度、烃链不饱和度选取不同结构的磷脂,先利用CHARMM-GUI网站构建不同磷脂组合的小模块膜体系,之后利用GROMACS将小模块膜体系进行扩展达到所需尺寸,再利用BUMPY脚本工具构建若干组不同的膜管模型;最后采用粗粒度水珠模拟探针并在膜管模型外周构建探针环得到膜管分裂模型;(2)模拟分裂收缩行为:利用GROMACS模拟分裂收缩行为:首先对每一个探针都施加一个恒速力朝向该探针所在水平面的膜管中心点以保证探针能够均匀地收缩,直至内层的脂质相互接触,该过程称为机械收缩阶段;然后对机械收缩阶段的最后一帧的探针继续进行牵引,直至膜管发生分裂,该过程称为分裂完成过程;(3)机理分析:对步骤(2)的两个过程进行伞形采样,并利用GROMACS中gmxwham模块对伞形采样的结果进行分析;利用VMD可视化软件捕捉膜分裂的动态过程及细节,通过VMD自带脚本分析膜体分裂过程中整体上的演变速率和变化行为;其中,各组膜管的膜层均包括公共组分和变量组分,公共组分为各组膜管共有的磷脂,变量组分为各组膜管区别于其他膜管的磷脂,变量组分按照选取的磷脂结构分为头基组、链长组和不饱和度组,头基组选择DPPE、DPPG、DPPS,链长组选择DTPA、DLPA、DPPA,不饱和度组选择DOPA、DAPA、DRPA,公共组分和变量组分的添加数目比例范围为1:1-1.5;通过BUMPY脚本工具建立膜管模型,选择Martini3粗粒化力场,温度设置为310K以模拟体内温度环境,膜管上下以周期性对接。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中国石油大学(华东),其通讯地址为:266580 山东省青岛市黄岛区长江西路66号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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