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恭喜苏州浪潮智能科技有限公司刘鑫获国家专利权

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龙图腾网恭喜苏州浪潮智能科技有限公司申请的专利一种优化蛋白质结构预测的方法、系统、设备和存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115035958B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-03-18发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210602616.0,技术领域涉及:G16B45/00;该发明授权一种优化蛋白质结构预测的方法、系统、设备和存储介质是由刘鑫设计研发完成,并于2022-05-30向国家知识产权局提交的专利申请。

一种优化蛋白质结构预测的方法、系统、设备和存储介质在说明书摘要公布了:本发明提供一种优化蛋白质结构预测的方法、系统、设备和存储介质,方法包括:修改完善openfold代码以实现对第二代深度学习神经网络结构alphafold2的初步跑通;将openfold中的数据进行切分以进行初步显存优化;对所述第二代深度学习神经网络结构alphafold2进行用户配置文件分析以确定当前显存消耗最大的模块;以及对当前显存消耗最大的模块进行数据切分以进行显存优化。本发明可快速实现alphafold2的训练任务,实现了对于长序列蛋白训练的支持,解决了训练对于硬件资源的强要求,且提高了训练性能。

本发明授权一种优化蛋白质结构预测的方法、系统、设备和存储介质在权利要求书中公布了:1.一种优化蛋白质结构预测的方法,其特征在于,包括如下步骤:修改完善openfold代码以实现对第二代深度学习神经网络结构alphafold2的初步跑通;将openfold中的数据进行切分以进行初步显存优化;对所述第二代深度学习神经网络结构alphafold2进行用户配置文件分析以确定当前显存消耗最大的模块;以及对当前显存消耗最大的模块进行数据切分以进行显存优化;其中,所述修改完善openfold代码以实现对第二代深度学习神经网络结构alphafold2的初步跑通包括:使用while循环控制openfold逐步读取文件,并采用FP32精度对openfold进行训练;所述将openfold中的数据进行切分以进行初步显存优化包括:将同一数据复制出多份,并通过分散函数切分数据以使得每个设备分配到一部分数据进行计算;以及响应于计算完成,使用聚合函数合并数据;将pytorch的分布式训练ddp修改为apex的ddp,并将softmax算子修改为torch自带的softmax。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人苏州浪潮智能科技有限公司,其通讯地址为:215000 江苏省苏州市吴中经济开发区郭巷街道官浦路1号9幢;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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