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龙图腾网恭喜中国科学院深圳先进技术研究院申请的专利一种用于动态分析蛋白-小分子的相互作用的方法、系统和计算机可读载体获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN114974399B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-03-18发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202110463779.0，技术领域涉及：G16B5/00；该发明授权一种用于动态分析蛋白-小分子的相互作用的方法、系统和计算机可读载体是由袁曙光;白冰;李红春;邹荣峰设计研发完成，并于2021-04-27向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种用于动态分析蛋白-小分子的相互作用的方法、系统和计算机可读载体在说明书摘要公布了：本发明涉及一种用于动态分析蛋白‑小分子的相互作用的方法、系统和计算机可读载体。具体公开了所述方法包括如下步骤：S1输入蛋白‑小分子的结构坐标类数据和或轨迹类数据；S2对步骤S1获得数据进行预检测和存储；S3将步骤S2存储的数据进行处理和分析；S4根据步骤S3获得数据进行2D可视化；S5根据步骤S3获得数据进行3D可视化。本发明的方法或系统能够对于多种文件类型格式的支持，能够提供动态相互作用分析。基于轨迹类文件能够得到3D动态相互作用可视化结果。且独有的2D可视化展示，提供了雷达图、2D动态轨迹相互作用分布来更清晰的展示所有相互作用的整个变化过程。

本发明授权一种用于动态分析蛋白-小分子的相互作用的方法、系统和计算机可读载体在权利要求书中公布了：1.一种动态分析蛋白-小分子的相互作用的方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：S1输入蛋白-小分子的结构坐标类数据和或轨迹类数据；S2对步骤S1获得数据进行预检测和存储；S3将步骤S2存储的数据进行处理和分析：S31将步骤S2存储的数据进行处理，获得pdb格式文件；S32对步骤S31获得的pdb格式文件中的数据，以gromacs进行模型构建、MD模拟，获得原始数据的均方根偏差、均方根波动数据，生成xvg格式结果文件，然后通过python脚本绘制出对应的均方根偏差、均方根图，保存结果图；S33对步骤S31获得的pdb格式文件中数据进行清洗，然后进行利用物理几何性质进行计算分析，得到xml类型的相互作用类型的结果文件；并保存相应数据；S4根据步骤S3获得数据进行2D可视化：S41绘制并展示蛋白-小分子相互作用雷达图，所述相互作用雷达图共9个，包括疏水相互作用雷达图、氢键相互作用雷达图、水桥相互作用雷达图、盐桥相互作用雷达图、pi-pi堆叠相互作用雷达图、阳离子-pi相互作用雷达图、卤素键相互作用雷达图、金属配合物相互作用雷达图和总相互作用雷达图；S42绘制并展示轨迹类数据的相互作用分布的热图，所述热图的横坐标为轨迹类数据中的不同帧，纵坐标代表与小分子相互作用的蛋白中的氨基酸位点，每个网格代表对应帧的对应氨基酸位点与小分子相互作用的个数和类型；S43展示步骤S32获得的均方根偏差、均方根图；S5根据步骤S3获得数据进行3D可视化：利用NGL技术，对步骤S33计算分析得到的xml类型的结果文件进行显示。

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