恭喜汕头大学姜大志获国家专利权
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龙图腾网恭喜汕头大学申请的专利一种基于交叉熵测度的癌症驱动基因识别方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115240768B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-04-25发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210782278.3,技术领域涉及:G16B20/50;该发明授权一种基于交叉熵测度的癌症驱动基因识别方法是由姜大志;林映青;何志辉设计研发完成,并于2022-07-05向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于交叉熵测度的癌症驱动基因识别方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于交叉熵测度的癌症驱动基因识别方法,包括步骤:获得癌症体细胞突变基因组数据集,根据所述基因组数据集构造出突变矩阵,计算基因的突变频率;将每个基因的突变频率映射到基因功能交互图信息得到基因突变网络,计算基因中心性分数、计算基因改进交叉熵分数,将所有突变基因的潜在得分按照由高到低的顺序排列,分数越高,表示该基因越可能是驱动基因。本发明对现有的基于基因排斥性方法的重要补充,本发明可以挖掘目前方法难以发现的低排斥性驱动基因,本发明还可以减少目前已有方法受到已知的蛋白质网络和生物通路容易出错或不完整的影响从而导致其性能受到限制。
本发明授权一种基于交叉熵测度的癌症驱动基因识别方法在权利要求书中公布了:1.一种基于交叉熵测度的癌症驱动基因识别方法,其特征在于,包括以下步骤:S1:获得癌症体细胞突变基因组数据集,下载子细胞隔间信息S以及基因功能交互图信息G,并存储到基因组学数据库中;S2:根据所述基因组数据集构造出突变矩阵M,计算基因的突变频率fi;将每个基因的突变频率映射到基因功能交互图信息G得到基因突变网络G’;S3:计算基因中心性分数、计算基因改进交叉熵分数;使用度中心性来测量基因i在突变子网Sk中影响程度βik,使用以下公式计算基因改进交叉熵分数: 其中,Hik为在突变网络k的基因i被识别成驱动基因的交叉分数,Nik为基因i的邻居在突变网络k中的邻居节点个数;S4:计算基因i被识别成驱动基因的分数sik s i k =β i k *H i k 使用基因i的潜在得分si最大的值作为最终结果: s i =maxs i 1 ,s i 2 ,s i 3 ,…,s i k ,k=1,2,…,K,其中k表示子细胞隔间。
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