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恭喜山东大学赵晓宇获国家专利权

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龙图腾网恭喜山东大学申请的专利一种基于参考基因组的针对多样本的转录组组装方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115101132B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-04-25发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210702525.4,技术领域涉及:G16B30/20;该发明授权一种基于参考基因组的针对多样本的转录组组装方法是由赵晓宇;于婷;马骏驰设计研发完成,并于2022-06-21向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于参考基因组的针对多样本的转录组组装方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于参考基因组的针对多样本的转录组组装方法,属于生物信息学中的转录本组装领域,具体步骤为:一利用序列比对工具对下机得到的原始测序数据进行分析,获得回帖到参考基因组上的结果;二针对每一个样本的回帖结果构建单个样本的初始剪接图;三将每个样本的传统剪接图整合为矢量加权剪接图VWSG;四生成代表转录本的路径。本发明的方法从融合多样本数据信息的角度所设计了新型转录组组装工具TransMeta。该工具在准确率precison、召回率recall、AUC以及F‑Score等多个评价指标上相较于其他常用算法均取得了令人鼓舞的提升。

本发明授权一种基于参考基因组的针对多样本的转录组组装方法在权利要求书中公布了:1.一种基于参考基因组的针对多样本的转录组组装方法,其特征在于,包括以下步骤:一提取待检测样本的mRNA,扩增,得到环化cDNA,上机测序;利用序列比对工具对下机得到的原始测序数据进行分析,获得回帖到参考基因组上的结果;二针对每一个样本的回帖结果构建单个样本的初始剪接图;对每个RNA-Seq样本,在将RNA-Seq数据回贴到参考基因组后,首先根据读段回贴坐标的重叠情况,将所有读段聚类到不同的基因座上;三将每个样本的传统剪接图整合为矢量加权剪接图VWSG;包括:3.1首先生成一个非加权的共识图GU=EU,JU,图中外显子和剪接位点是GkEk,Jkk=1,2,...,S中所有出现的外显子和剪接位点的总集合,EU是Ek的总集合,JU是Jk的总集合,Ek是外显子的集合,Jk是剪接位点的集合;3.2利用矢量对GU中的外显子和剪接位点进行加权;四生成代表转录本的路径,包括:4.1根据余弦相似度对每个外显子的传入和传出的剪接位点进行组合;4.2通过标签设置算法重构转录本;4.3重构每个样本的转录本集合;4.4生成最终的多样本转录组。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人山东大学,其通讯地址为:250000 山东省济南市历下区山大南路27号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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