湖南工业大学周立前获国家专利权
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龙图腾网获悉湖南工业大学申请的专利一种基于有界核范数正则化的新型冠状病毒感染引起的肺炎药物筛选模型获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN113921106B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-04-25发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202110809155.X,技术领域涉及:G16H20/10;该发明授权一种基于有界核范数正则化的新型冠状病毒感染引起的肺炎药物筛选模型是由周立前;王娟娟;彭利红;田雄飞;王畅;沈领设计研发完成,并于2021-07-16向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于有界核范数正则化的新型冠状病毒感染引起的肺炎药物筛选模型在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于有界核范数正则化的新型冠状病毒感染引起的肺炎药物筛选模型。首先,通过公开可用的数据库整理方法所需要的病毒和药物的相关信息;其次,分别计算病毒和药物的相似性;再次,构建异构网络,整合邻接矩阵;第四,提出VDA‑GBNNR模型,填补病毒与药物之间的未知的关联,根据得分排名先后筛选出抗新型冠状病毒的候选药物;最后,将预测出的排名靠前的小分子药物与受体蛋白进行分子对接,得到分子结合能与结合位点。本发明通过结合核范数正则化来实现有噪声的矩阵补全,有效地解决了过拟合问题,并且加入一个范围约束,强制所有预测结果的输出矩阵内的所有值在特定范围内。实验结果表明,该方法得到的AUC值较高,能够较为准确地预测病毒与药物的关联。
本发明授权一种基于有界核范数正则化的新型冠状病毒感染引起的肺炎药物筛选模型在权利要求书中公布了:1.一种基于有界核范数正则化的新型冠状病毒感染引起的肺炎药物筛选模型,其特征在于,包括以下步骤:S1.将已知的病毒与药物关系转化为已知的病毒与药物网络:从数据库中寻找病毒和药物关系转换成邻接矩阵,其中是病毒的个数,代表药物的个数,将有关联的病毒和药物的值记为1,否则记为0;S2.计算病毒的相似性和药物的相似性:S21.计算病毒的全基因组序列相似性和药物的化学结构相似性,分别得到病毒全基因组序列相似性矩阵和药物化学结构相似性矩阵;S22.分别计算病毒和药物的高斯关联谱核相似性,得到病毒的高斯关联谱核相似性矩阵和药物的高斯关联谱核相似性矩阵;S23.整合上述所有病毒的相似性矩阵,药物的相似性矩阵,计算最终的病毒相似性矩阵、药物相似性矩阵;步骤S23的具体过程如下:将病毒的全基因组序列相似性与其高斯关联谱核相似性线性组合,得到最终的病毒相似性矩阵,构建病毒相似性网络;将药物的化学结构相似性与其高斯关联谱核相似性进行线性组合,得到最终的药物相似性矩阵,构建药物的相似性网络;S3.构建异构网络,整合邻接矩阵:所述异构网络由病毒-病毒关系子网络、药物-药物关系子网络、病毒-药物关联网络组成,所述邻接矩阵由病毒相似性矩阵、药物相似性矩阵和病毒-药物关联矩阵整合而成;S4.利用带有高斯关联谱核相似性的有界核范数正则化模型进行病毒和药物的关联预测与药物筛选;步骤S4的具体过程如下:采用公式6的VDA-GBNNR模型求解病毒-药物关联的预测得分: 其中是平衡核范数和误差项的参数,使用交替方向乘子法ADMM来求解VDA-GBNNR,并且引入参数,为惩罚参数,利用带有交叉验证的网格搜索算法寻找的最优值,最终求解得到一个新的矩阵,即为模型的预测得分矩阵,计算出相应的病毒-药物关联的预测得分,病毒-药物对得分越高,则它们潜在的关联关系越大。
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