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龙图腾网恭喜之江实验室申请的专利一种功能蛋白质挖掘和筛选方法及装置获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119517171B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-04-29发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202510081736.4，技术领域涉及：G16B30/10；该发明授权一种功能蛋白质挖掘和筛选方法及装置是由李茜;陈高祥;傅帅;黄锐;骆正阳;冯琳清设计研发完成，并于2025-01-20向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种功能蛋白质挖掘和筛选方法及装置在说明书摘要公布了：本发明公开了一种功能蛋白质挖掘和筛选方法及装置，将蛋白结构预测、蛋白质功能注释、蛋白簇挖掘等多维度的生物信息学分析与基于蛋白质大语言的人工智能方法结合起来，构建了一个针对功能蛋白的挖掘和筛选的流程。引入蛋白质的结构分析，利用蛋白质结构与功能的关联，通过构建结构相似性图谱，发掘功能相近的蛋白。蛋白质大语言模型能够包含蛋白结构，翻译后修饰和生物物理学特性等与蛋白质功能相关的特征参数，并以向量矩阵的形式揭示蛋白内在的功能关联性。通过引入这两种分析手段，并结合传统的基于序列的蛋白质功能注释的方法，使得序列相似性和亲缘度更低，但是拥有相应功能的蛋白被挖掘和筛选出来，从而能够更加高效精准地利用生物大分子。

本发明授权一种功能蛋白质挖掘和筛选方法及装置在权利要求书中公布了：1.一种功能蛋白质挖掘和筛选方法，其特征在于，包括：整合若干个蛋白质数据库，并获取蛋白质的物种序列号信息映射文件，以构建蛋白质比对数据库；将目标功能蛋白参考序列，与蛋白质比对数据库进行蛋白质-蛋白质之间序列的比对，输出比对到蛋白质比对数据库的第一蛋白序列及其物种名称和物种序列号；参考蛋白质及其序列是已知的，参考蛋白质序列即目标功能蛋白参考序列；基于蛋白质功能域结构域数据库注释参考序列的功能域和结构域片段，选择参考序列上共有的目标功能相关并且其片段对序列覆盖度大于第一预设阈值的功能域和结构域，从第一蛋白序列中筛选出覆盖有所选择的功能域和结构域片段的第二蛋白序列，从而获取第二蛋白质；预测第二蛋白质和参考蛋白质的三级结构并进行聚类，从第二蛋白质选出能够同参考蛋白质结构聚为一类的蛋白质作为第一候选蛋白质；获取物种序列号为索引的分类信息文件，基于该文件获取参考蛋白质和第二蛋白质对应物种的分类序列号，基于蛋白质大语言模型对第二蛋白序列和参考序列进行向量化并合并为一个向量矩阵，将该向量矩阵映射到分类序列号上，去除向量矩阵中特征值大于等于第二预设阈值的特征，得到新的向量矩阵；使用聚类模型对新的向量矩阵进行聚类，选出与参考蛋白质同标签的蛋白质作为第二候选蛋白质；从参考物种中挖掘出目标功能通路的蛋白簇，基于目标功能通路的蛋白簇对候选物种进行筛选，筛选后的候选物种对应的候选蛋白质即为目标蛋白质。

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