恭喜北京玻色量子科技有限公司马寅获国家专利权
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龙图腾网恭喜北京玻色量子科技有限公司申请的专利基因组组装顺序确定方法和系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119296649B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-02发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411729975.8,技术领域涉及:G16B30/20;该发明授权基因组组装顺序确定方法和系统是由马寅;文凯;曹崇育;陈亮;巨江伟设计研发完成,并于2024-11-29向国家知识产权局提交的专利申请。
本基因组组装顺序确定方法和系统在说明书摘要公布了:本公开实施例提供一种基因组组装顺序确定方法和系统。基因片段组装顺序确定方法包括:以将所有基因片段排序组装后端部重叠长度最大为目标构建目标函数;以所有的基因片段在拼接序列中出现一次,并且拼接序列的各个排序位置仅能有一段基因片段为约束构建出现次数‑位置约束函数;整合目标函数和出现次数‑位置约束函数,得到全局最优化函数;采用量子计算机对全局最优化函数进行优化解算得到解算结果,并确定各个基因片段的组装顺序。本方案通过将基因组组装顺序确定用与伊辛模型等价的函数模型表征,利用可以求解伊辛模型的量子计算机进行解算,确定各个基因片段的组装顺序,利用量子计算机的计算速度优势,实现基因片段拼接问题的快速解算。
本发明授权基因组组装顺序确定方法和系统在权利要求书中公布了:1.一种基因组组装顺序确定方法,其特征在于,包括:基于基因组中所有基因片段的两两端部重叠长度构建目标函数,其中所述目标函数包括按照拼接序列组装后的基因组中相邻基因片段的重叠长度之和,所述目标函数以所述重叠长度之和最大为目标;以所有基因片段在所述拼接序列中出现一次,并且所述拼接序列的各个排序位置仅能有一段基因片段为约束,构建约束函数;将所述目标函数和所述约束函数加权求和,得到全局最优化函数,所述全局最优化函数为二次无约束二值函数或者与二次无约束二值函数形式等价的函数;采用量子计算机对所述全局最优化函数进行优化解算得到解算结果,以确定各个基因片段的组装顺序。
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