恭喜深圳大学陈杰获国家专利权
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龙图腾网恭喜深圳大学申请的专利一种蛋白质甲基化位点预测方法、装置及设备获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114882952B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-09发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210468759.7,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权一种蛋白质甲基化位点预测方法、装置及设备是由陈杰;李坚强;顾凌嫣;陈廷柏;梁中明设计研发完成,并于2022-04-29向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种蛋白质甲基化位点预测方法、装置及设备在说明书摘要公布了:本申请提供一种蛋白质甲基化位点预测方法、装置及设备,涉及生物信息技术领域,能够更准确地预测蛋白质甲基化位点,鲁棒性较高。该方法包括:获取待测蛋白质的三维结构数据,蛋白质由多个氨基酸组成;根据三维结构数据,构建以氨基酸为节点的图结构,图结构中每一个节点对应一个氨基酸;根据预设参数,从图结构中提取子图,预设参数包括子图跳数和距离阈值;将子图输入到训练好的图卷积神经网络中进行甲基化位点预测。
本发明授权一种蛋白质甲基化位点预测方法、装置及设备在权利要求书中公布了:1.一种蛋白质甲基化位点预测方法,其特征在于,所述方法包括:获取待测蛋白质的三维结构数据,所述蛋白质由多个氨基酸组成;根据所述三维结构数据,构建以氨基酸为节点的图结构,所述图结构中每一个节点对应一个氨基酸;根据预设参数,从所述图结构中提取子图,所述预设参数包括子图跳数和距离阈值;将所述子图输入到训练好的图卷积神经网络中进行甲基化位点预测;所述根据预设参数,从所述图结构中提取子图,包括:按照蛋白质序列,以所述蛋白质序列中任意一个氨基酸作为所述子图的起始节点;以所述起始节点为中心,根据所述预设参数,从所述图结构中提取所述起始节点对应的氨基酸的子图;所述根据所述三维结构数据,构建以氨基酸为节点的图结构中,包括:获取任意两个氨基酸的中心碳原子之间的距离值;当所述距离值小于距离阈值时,确定所述的任意两个氨基酸相连;所述将所述子图输入到训练好的图卷积神经网络中进行甲基化位点预测之前,还包括:对训练好的所述图卷积神经网络进行贝叶斯优化,优化进行子图提取时使用到的子图跳数和距离阈值。
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