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恭喜中南大学彭小清获国家专利权

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龙图腾网恭喜中南大学申请的专利DMR集合识别结果评估方法、评估系统及选择方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114400050B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-09发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210245595.1,技术领域涉及:G16B40/20;该发明授权DMR集合识别结果评估方法、评估系统及选择方法是由彭小清;崔万新;孔祥艳;胡德华;盛羽设计研发完成,并于2022-03-14向国家知识产权局提交的专利申请。

DMR集合识别结果评估方法、评估系统及选择方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种DMR集合识别结果评估方法,包括对于每个预测的差异甲基化区域以区域内探针CpG位点为中心对CpG位点进行聚类;计算每个探针在实验组和对照组甲基化芯片数据上的平均甲基化水平差值;计算每个探针CpG位点与对应类中其他CpG位点的相关系数;计算每个差异甲基化区域在实验组和对照组甲基化芯片数据上的甲基化水平差异;计算每个待评估方法的评估指标完成DMR集合识别结果的评估。本发明还公开了一种实现所述DMR集合识别结果评估方法的评估系统,以及包括了所述DMR集合识别结果评估方法的选择方法。本发明无需匹配额外生物数据,能够为选择更优异的差异甲基化区域集合提供指导,客观性高、可靠性高且科学合理。

本发明授权DMR集合识别结果评估方法、评估系统及选择方法在权利要求书中公布了:1.一种DMR集合识别结果评估方法,其特征在于包括如下步骤:S1.对于每个预测的差异甲基化区域,以区域内探针CpG位点为中心,对区域内所有的CpG位点进行聚类;S2.计算每个探针在实验组甲基化芯片数据上和对照组甲基化芯片数据上的平均甲基化水平差值;S3.基于公共数据库中其他组织的甲基化测序数据,计算每个探针CpG位点与对应类中其他CpG位点的相关系数;S4.基于步骤S2得到的平均甲基化水平差值和步骤S3得到的相关系数,计算每个差异甲基化区域在实验组甲基化芯片数据上和对照组甲基化芯片数据上的甲基化水平差异;S5.对于每个待评估方法所预测的差异甲基化区域集合,计算每个待评估方法的评估指标,完成DMR集合识别结果的评估;具体为对于每个待评估方法所预测的差异甲基化区域集合,基于差异甲基化区域所对应的甲基化水平差异、探针总数、长度和包含的CpG位点数,计算每个待评估方法的评估指标,完成DMR集合识别结果的评估;具体实施时,包括如下步骤:S5.1.根据待评估方法所预测的差异甲基化区域集合,将对应的甲基化水平差异分成Nn个区间,分别统计落在各个区间的差异甲基化区域集合所包含CpG位点总数目和探针总数目,同时计算各个区间的差异甲基化区域的总长度;Nn为正整数;S5.2.采用如下算式计算待评估方法的第一评估指标DMRnt: 式中wi为第i个区间的权重值;ni为落在第i个区间的差异甲基化区域集合所包含CpG位点总数目;Ni为落在第i个区间的差异甲基化区域集合所包含探针的总数目;Li为第i个区间的差异甲基化区域的总长度;S5.3.采用如下算式计算待评估方法的第二评估指标DMRlt: 式中Nn为甲基化水平差异划分的区间数;S5.4.根据步骤S5.2和S5.3计算的评估指标,对待评估方法得到的DMR集合识别结果进行评估。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中南大学,其通讯地址为:410083 湖南省长沙市岳麓区麓山南路932号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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