恭喜重庆问创医学检验实验室有限公司李冬冬获国家专利权
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龙图腾网恭喜重庆问创医学检验实验室有限公司申请的专利一种SNV检测数据处理方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119673274B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-13发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510176139.X,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权一种SNV检测数据处理方法是由李冬冬;朱萍;聂艾维设计研发完成,并于2025-02-18向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种SNV检测数据处理方法在说明书摘要公布了:本发明涉及一种SNV检测数据处理方法,包括以下步骤:S1、数据预处理:获取每个基因检测位点的荧光信号值,并计算每个芯片位点的log2ratio值;S2、内部质控:将获取芯片上的质控位点的log2ratio数据与大样本数据建立的“标准线”分别作为“X”和“Y”建立线性回归方程;S3、分型阈值建立:用标准品建立检测位点的分型阈值;S4、服务分析模板判读:将测试样品的基因检测位点用S2建立的线性回归方程进行log2ratio校正,并依据测试样品的基因检测位点校正后最终ratio数值与分型阈值进行基因型分型,本发明是一种SNV芯片数据处理流程,以实现对SNV芯片数据的高效、准确分析。
本发明授权一种SNV检测数据处理方法在权利要求书中公布了:1.一种SNV检测数据处理方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、数据预处理:获取每个基因检测位点的荧光信号值,并计算每个芯片位点的log2ratio值;S2、内部质控:将获取芯片上的质控位点的log2ratio数据与大样本数据建立的“标准线”分别作为“X”和“Y”建立线性回归方程;S3、cut-off值建立:用标准品建立检测位点的cut-off值;S4、服务分析模板判读:将测试样品的基因检测位点用S2建立的线性回归方程进行log2ratio校正,并依据测试样品的基因检测位点校正后最终ratio数值与cut-off值进行基因型分型;S1中,荧光信号值包括每个基因检测位点在532nm荧光波段的前景值扣除背景值后的数值F532-B,以及每个基因检测位点在635nm荧光波段的前景值扣除背景值后的数值F635-B,每个芯片位点的log2ratio值为将每个点的F532-B除以F635-B后的数值取以2为底的对数值;S3中,cut-off值建立方法为: S4中log2ratio校正方法包括:将所有的基因检测位点log2ratio数值除以线性回归方程的斜率值后可得到斜率校正ratio,再将斜率校正ratio减去线性回归方程的截距值后得到最终ratio;分型逻辑:测试样品的最终ratio值Highcut-off,基因型别为T1;若测试样品的最终ratio值Lowcut-off,基因型别为T3;若Lowcut-off≤测试样品的最终ratio值≤Highcut-off,基因型别为T2。
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