佛山大学柴华获国家专利权
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龙图腾网获悉佛山大学申请的专利一种基于多组学数据的癌症亚型识别方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN118762756B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-13发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410729630.6,技术领域涉及:G16B40/20;该发明授权一种基于多组学数据的癌症亚型识别方法及系统是由柴华;许乐凯;黄依倩;宋心鹏;陈可楠;赵梓涛;管婷;唐植锐;何敏藩设计研发完成,并于2024-06-06向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于多组学数据的癌症亚型识别方法及系统在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于多组学数据的癌症亚型识别方法及系统,该方法包括:获取多组学基因数据,并对所述多组学基因数据进行预处理,获得初始数据;基于无监督多任务聚类模型对所述初始数据进行聚类处理,获得癌症亚型标签;基于mRNA特征,采用XGBOOST模型对所述癌症亚型标签进行拟合,获得特征贡献度。可见,本发明有效地对癌症亚型进行识别并且提供可解释性,有利于患者个性化治疗以及靶向药物开发。
本发明授权一种基于多组学数据的癌症亚型识别方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种基于多组学数据的癌症亚型识别方法,其特征在于,所述方法包括:获取多组学基因数据,并对所述多组学基因数据进行预处理,获得初始数据;基于无监督多任务聚类模型对所述初始数据进行聚类处理,获得癌症亚型标签;基于mRNA特征,采用XGBOOST模型对所述癌症亚型标签进行拟合,获得特征贡献度;其中,所述对所述多组学基因数据进行预处理,获得初始数据,包括:对所述多组学基因数据中缺失超过20%的样本以及特征进行删除;对剩余的缺失项使用中位数进行填补;对填补后的多组学基因数据以及用于独立验证的数据进行基因对齐;对多组学基因数据进行标准化,获得初始数据;所述基于无监督多任务聚类模型对所述初始数据进行聚类处理,获得癌症亚型标签,包括:对所述多组学数据进行融合处理,获得多组学融合数据;通过多头自注意力机制对所述多组学融合数据进行处理,获得自注意力输出特征;通过变自分编码器对所述自注意力输出特征进行处理,获得多组学低维特征;对所述多组学低维特征进行聚类处理,获得癌症亚型标签;所述对所述多组学低维特征进行聚类处理,获得癌症亚型标签,包括:基于聚类算法以及所述初始数据,确定聚类个数;根据聚类个数以及特征相似性损失函数对所述多组学低维特征进行聚类,获得癌症亚型标签;所述基于聚类算法以及所述初始数据,确定聚类个数,包括:通过k均值聚类算法以及所述初始数据,计算不同聚类个数的WSS值;根据得到的WSS值绘制成肘部图,并根据所述肘部图确定聚类个数。
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