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恭喜深圳大学黄裕安获国家专利权

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龙图腾网恭喜深圳大学申请的专利一种用于预测转录因子-靶基因相互作用的方法及模型获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114420203B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-13发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202111493609.3,技术领域涉及:G16B20/00;该发明授权一种用于预测转录因子-靶基因相互作用的方法及模型是由黄裕安;潘贵青;王佳;林秋镇;李坚强设计研发完成,并于2021-12-08向国家知识产权局提交的专利申请。

一种用于预测转录因子-靶基因相互作用的方法及模型在说明书摘要公布了:本发明公开的一种用于预测转录因子‑靶基因相互作用的方法及模型,所述用于预测转录因子‑靶基因相互作用的方法是基于随机游走的异构图嵌入算法来预测TF与靶基因潜在的相互作用关系,采用随机游走方式在异构图中生成节点的语句,然后采用滑动窗口方式提取训练样本,经过异构图嵌入算法生成节点的特征,进而预测TF与靶基因之间未被发现的相互作用关系。并且,由于本发明在异构图中添加了TG节点,采用随机游走生成样本路径的过程中,在选择TG或者疾病节点时,设定一个概率,以一定概率选择TG或者疾病,在解决冷启动问题的同时,能够更好地捕获异构网络的节点信息。

本发明授权一种用于预测转录因子-靶基因相互作用的方法及模型在权利要求书中公布了:1.一种用于预测转录因子-靶基因相互作用的方法,其特征在于,具体包括步骤:从基因数据库提取转录因子与靶基因的连接和从疾病数据库提取基因与疾病的连接,构建一个三种节点类型的第一异构网络;假设转录因子与目标基因之间的节点为TG,所述第一异构网络与所述节点TG形成第二异构网络;采用基于元路径的随机游走方式,从所述第二异构网络生成样本路径;基于所述样本路径构建图嵌入模型,给定样本对节点,利用所述图嵌入模型将所述样本对节点的嵌入向量连接起来作为全连接层的输入,获得所述节点的结果;根据所述结果从所述第二异构网络中获得所述节点最终的嵌入,分别形成转录因子嵌入矩阵F和靶基因的嵌入矩阵G,计算两个矩阵的点积获得预测得分矩阵R,其中第i行第j列的值表示第i个转录因子与第j个靶基因的预测得分;所述元路径的表示形式为其中表示两个不同类型节点V1和Vn之间的关联;根据所述元路径的表示形式,计算第k步转移的概率p,其公式如下: 其中表示节点的Vt+1类型的相邻节点;所述图嵌入模型由第一神经网络模型和第二神经网络模型组成;所述第一神经网络模型包括构建模型和通过所述模型获得节点嵌入;所述第二神经网络模型用于计算一对节点嵌入之间的相似度。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人深圳大学,其通讯地址为:518060 广东省深圳市南山区南海大道3688号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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