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恭喜豪夫迈·罗氏有限公司M·库克里卡获国家专利权

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龙图腾网恭喜豪夫迈·罗氏有限公司申请的专利识别高错误单分子读段中的短基序的序列比对系统和方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115698330B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-13发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202180038644.8,技术领域涉及:C12Q1/6869;该发明授权识别高错误单分子读段中的短基序的序列比对系统和方法是由M·库克里卡;B·刘设计研发完成,并于2021-05-26向国家知识产权局提交的专利申请。

识别高错误单分子读段中的短基序的序列比对系统和方法在说明书摘要公布了:本文描述了一种新颖的比对方法,所述比对方法利用多阶段二级分析,每个阶段逐渐减少下一个或多个阶段要分析的数据量,但增加对从前一个或多个阶段接收到的其余数据的搜索的详尽性。这样,可在一个或多个早期阶段从最初的大型数据池中快速地识别噪声较小的比对,而在一个或多个后期计算阶段可从更小的数据池中同等快速地识别噪声非常大的比对,从而保持靶灵敏度,同时减少总体计算时间。

本发明授权识别高错误单分子读段中的短基序的序列比对系统和方法在权利要求书中公布了:1.一种用于将序列读段与参考序列进行比对的方法,所述方法包括:使用第一种子长度利用Burrows-Wheeler变换将来自序列读段整个群的序列读段第一集合与参考序列进行比对,其中基于所述序列读段的错误率选择所述第一种子长度;掩蔽所述序列读段第一集合,使得所述序列读段整个群包括经掩蔽的序列读段和非掩蔽的序列读段的子集;使用第二种子长度利用所述Burrow-Wheeler变换将来自所述非掩蔽的序列读段的序列读段第二集合与所述参考序列进行比对,其中所述第二种子长度小于所述第一种子长度;以及基于所述序列读段第一集合和所述序列读段第二集合确定所述序列读段与所述参考序列的比对;所述方法进一步包括迭代地掩蔽和比对序列读段的另外集合与具有更小种子长度的读段的每个后续集合,以及确定所述序列读段与所述序列读段的另外集合的比对;其中所述第一种子长度小于10个碱基,并且其中所述序列读段的错误率为至少5%。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人豪夫迈·罗氏有限公司,其通讯地址为:瑞士巴塞尔;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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