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恭喜生命科技股份有限公司S·萨达获国家专利权

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龙图腾网恭喜生命科技股份有限公司申请的专利用于评估微生物群体的组合物和方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115176032B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-13发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202080082093.0,技术领域涉及:C12Q1/686;该发明授权用于评估微生物群体的组合物和方法是由S·萨达;A·麦克吉齐;R·哥蒂姆卡拉;D·马力欧;H·欣;A·埃维因;W·李;B·吉乌斯;F·海兰;J·奥阳设计研发完成,并于2020-10-09向国家知识产权局提交的专利申请。

用于评估微生物群体的组合物和方法在说明书摘要公布了:本公开提供了组合物和方法,以及包含所述组合物和方法的组合、试剂盒和系统,用于样品,具体地说,生物样品中的核酸的扩增、检测、表征、评估、剖析和或测量。本文提供的组合物和方法包含用于选择性扩增的微生物种靶特异性核酸引物的组合和或用于扩增来自一大群分类学相关微生物的核酸的引物的组合。在一方面,使用所述组合物和方法获得的经扩增的核酸可用于各种过程,包含核酸测序,并用于检测微生物种的存在和评估各种样品中的微生物群体。根据教导和原理,提供了新的方法、系统和非暂时性机器可读存储介质来压缩参考序列数据库,所述参考序列数据库用于映射序列读段以用于微生物群体的分析和剖析。

本发明授权用于评估微生物群体的组合物和方法在权利要求书中公布了:1.一种系统,其包括:机器可读存储器;和处理器,所述处理器被配置成执行机器可读指令,所述机器可读指令当由所述处理器执行时使所述系统执行方法,所述方法包括:接收多个核酸序列读段,其中所述序列读段包含多个16S序列读段;第一次将所述多个16S序列读段映射到多个压缩的16S参考序列,其中每个压缩的16S参考序列包含用于种的对应菌株的高变节段集,其中对16SrRNA基因序列数据库中含有的全长16SrRNA基因序列应用计算机PCR模拟,基于16S引物池中的引物生成压缩的16S参考序列;生成含有映射到所述高变节段集中的每个高变节段的16S序列读段的读段计数的读段计数矩阵,其中所述读段计数矩阵的行对应于种的菌株并且列对应于所述高变节段;通过对所述读段计数应用取阈值来缩减所述读段计数矩阵,以形成缩减的读段计数矩阵;基于使用所述缩减的读段计数矩阵从全长16S参考序列的数据库选择相应的全长16S参考序列压缩全长16S参考序列的数据库以形成全长16S参考序列的缩减集,全长16S参考序列的所述缩减集存储在存储器中;第二次将所述多个16S序列读段映射到全长16S参考序列的所述缩减集;对映射到全长16S参考序列的所述缩减集中的每个全长参考的16S序列读段进行计数,以形成第二读段计数集;将所述第二读段计数集中的读段计数归一化,以形成归一化计数;针对给定水平聚合所述归一化计数以形成聚合计数,其中所述给定水平是种水平、属水平或科水平;以及对所述聚合计数应用阈值以检测样品中给定水平的微生物的存在。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人生命科技股份有限公司,其通讯地址为:美国加利福尼亚州;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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