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恭喜东华理工大学南昌校区陈军获国家专利权

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龙图腾网恭喜东华理工大学南昌校区申请的专利一种定量鉴定基因交互强度的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119943159B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-13发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510425447.1,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权一种定量鉴定基因交互强度的方法是由陈军;翟文;陈伦林设计研发完成,并于2025-04-07向国家知识产权局提交的专利申请。

一种定量鉴定基因交互强度的方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种定量鉴定基因交互强度的方法,包括以下步骤:S1、Hi‑C文库构建及测序;S2、数据质控和比对;S3、未比对reads的切割和重新比对;S4、基因相关区域reads计数;S5、交互强度的定量分析;本发明通过将染色体交互数据转化为基因与基因之间的交互强度,这样不仅可以识别不同基因之间的相互作用关系,还能够对这些相互作用的强度进行量化,为深入理解基因调控网络和功能研究提供了一种定量化的分析手段。

本发明授权一种定量鉴定基因交互强度的方法在权利要求书中公布了:1.一种定量鉴定基因交互强度的方法,其特征在于,包括以下步骤: S1、Hi-C文库构建及测序 对待分析的样本进行Hi-C文库的构建,应用高通量测序平台获取Hi-C数据,获得的数据为双端测序reads; S2、数据质控和比对 将获得的Hi-C测序数据进行质量控制,过滤掉低质量reads,使用bowtie2软件将质控后的reads比对到参考基因组上,得到比对结果一,并保留未比对上的reads; S3、未比对reads的切割和重新比对 将未比对上的reads采用Hi-C建库时使用的限制性内切酶的酶切位点进行切割,将切割剩下的reads重新使用bowtie2软件比对到参考基因组上,得到比对结果二,然后利用samtools软件将比对结果一和比对结果二合并生成新的bam文件并排序; S4、基因相关区域reads计数 利用注释文件标注基因相关区域,基因相关区域包括基因的启动子区域,下游增强子区域,基因body区域,CDS区域,外显子区域和内含子区域,根据区域坐标统计位置,利用自建python脚本,筛选bam文件,根据基因的调控模式,确保配对的reads一端位于某一基因的上述一个或多个区域,另一端位于其他基因的上述一个或多个区域,统计位于这些基因区域的readscount或者标准化后的readscount,用于评估某一基因到其他基因的交互调控的强度。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人东华理工大学南昌校区,其通讯地址为:330000 江西省南昌市经济技术开发区广兰大道418号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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