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河南大学宋纯鹏获国家专利权

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龙图腾网获悉河南大学申请的专利一种麦类D基因组泛基因外显子捕获测序芯片及其设计方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115323046B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-13发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202211147663.7,技术领域涉及:C12Q1/6869;该发明授权一种麦类D基因组泛基因外显子捕获测序芯片及其设计方法是由宋纯鹏;李浩;周云;刘一帆;陈中旭;李成琳;李政;朱乐乐;范芮晓;刘栩沁;聂芳;李灿;谢金金设计研发完成,并于2022-09-19向国家知识产权局提交的专利申请。

一种麦类D基因组泛基因外显子捕获测序芯片及其设计方法在说明书摘要公布了:本发明属于作物分子育种及功能研究领域,具体涉及一种麦类D基因组泛基因外显子捕获测序芯片及其设计方法。本发明将节节麦基因组及小麦D亚基因组进行整合,采用迭代法提取基因编码区序列,使用Kmer分类计数分组扩增获得节节麦泛基因组捕获探针,即为麦类D基因组泛基因外显子捕获测序芯片。本发明采用泛基因组探针的设计,能够更好应用于不同D亚基因组衍生材料的检测,能够覆盖不同节节麦的遗传变异。本发明的外显子捕获测序芯片既能够实现节节麦衍生全基因组外显子区域的高覆盖度,也能准确的用于节节麦衍生的渐渗系或者人工合成材料的外源片段鉴定,并且极大了降低了测序和分析成本。

本发明授权一种麦类D基因组泛基因外显子捕获测序芯片及其设计方法在权利要求书中公布了:1.一种麦类D基因组泛基因外显子捕获测序芯片,其特征在于,采用以下方法设计获得:将节节麦基因组及小麦D亚基因组进行整合,采用迭代法提取基因编码区序列,使用Kmer分类计数分组扩增获得节节麦泛基因组捕获探针,即为麦类D基因组泛基因外显子捕获测序芯片; 其中,将节节麦基因组及小麦D亚基因组进行整合,采用迭代法提取基因编码区序列包括: 步骤一、使用节节麦A材料的基因编码区序列作为探针的起始模板P1; 步骤二、使用起始模板P1对节节麦B材料的基因编码区序列进行比对覆盖,将节节麦B材料的基因编码区序列上未能被起始模板P1覆盖的区域加入起始模板P1中获得模板P2; 步骤三、使用模板P2对节节麦C材料的基因编码区序列进行比对覆盖,将节节麦C材料的基因编码区序列上未能被覆盖的区域加入模板P2中获得模板P3; 步骤四、重复步骤三,采用迭代法完成N个节节麦材料的基因编码区序列的比对覆盖、以及小麦D亚基因组的基因编码区序列的比对覆盖,向模板中加入本步骤所检测的节节麦材料的基因编码区序列和小麦D亚基因组的基因编码区序列未能被覆盖的区域,获得最终的泛基因组模板;所述N为正整数; 步骤二、三、四中,比对覆盖具体为:使用Blat、BLAST、Minimap2软件进行同源比对,比对的参数为:比对一致性不低于98%,且比对长度不少于100bp。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人河南大学,其通讯地址为:475000 河南省开封市龙亭区河南大学金明校区;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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