恭喜四川省计算机研究院;成都信息工程大学许源源获国家专利权
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龙图腾网恭喜四川省计算机研究院;成都信息工程大学申请的专利一种单细胞数据降噪方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119479808B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-24发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411301445.3,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权一种单细胞数据降噪方法是由许源源;肖钦引;张永清;何嘉;喻云;李天豪;贺锶函;刘宇航设计研发完成,并于2024-09-18向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种单细胞数据降噪方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种单细胞数据降噪方法,涉及细胞数据处理领域,本方法基于DNA序列和RNA序列进行建模,同时预测染色质可及性和基因表达状态,并整合成对的单细胞多组学数据,将分类器的权重作为两种组学的细胞低维特征,利用对比学习学习其中的细胞异质性,刻画单细胞数据的真实轮廓和生物学信息,对单细胞数据集进行有效降噪。
本发明授权一种单细胞数据降噪方法在权利要求书中公布了:1.一种单细胞数据降噪方法,其特征在于,包括以下步骤: S1、从scRNA-seq数据中提取DNA序列并将其转录为RNA序列;从scATAC-seq数据中提取DNA序列; S2、将转录得到的RNA序列和从scATAC-seq数据中提取得到的DNA序列分别编码为独热编码矩阵,对应得到DNA序列编码矩阵和RNA序列编码矩阵; S3、将DNA序列编码矩阵和RNA序列编码矩阵进行拼接,得到拼接矩阵; S4、通过堆叠的卷积神经网络分别获取DNA序列编码矩阵的特征、RNA序列编码矩阵的特征,以及拼接矩阵的特征; S5、将DNA序列编码矩阵与其特征进行拼接,得到DNA融合特征;将RNA序列编码矩阵与其特征进行拼接,得到RNA融合特征; S6、通过训练后的门控网络将DNA融合特征与拼接矩阵的特征进行融合,得到DNA混合特征;通过训练后的门控网络将RNA融合特征与拼接矩阵的特征进行融合,得到RNA混合特征; S7、将DNA混合特征与DNA序列编码矩阵进行残差连接,得到scATAC-seq数据的序列嵌入;将RNA混合特征与RNA序列编码矩阵进行残差连接,得到scRNA-seq数据的序列嵌入; S8、将scATAC-seq数据的序列嵌入作为训练后的门控网络中分类器的输入,获取染色质可及性预测概率值;将scRNA-seq数据的序列嵌入作为训练后的门控网络中分类器的输入,获取基因表达状态的预测概率值; S9、根据染色质可及性预测概率值和基因表达状态的预测概率值对scATAC-seq数据和scRNA-seq数据的计数矩阵进行修正,完成单细胞数据降噪。
如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人四川省计算机研究院;成都信息工程大学,其通讯地址为:610042 四川省成都市成科西路3号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。
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