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北京泛生子基因科技有限公司;北京泛生子生物技术有限公司刘肖川获国家专利权

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龙图腾网获悉北京泛生子基因科技有限公司;北京泛生子生物技术有限公司申请的专利一种用于人血液肿瘤微小残留监测模型获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119943149B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-15发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510412727.9,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种用于人血液肿瘤微小残留监测模型是由刘肖川;王雁;钟夏;杨宇飞;董永芳;武玉玲;牛泽雄;王思振设计研发完成,并于2025-04-03向国家知识产权局提交的专利申请。

一种用于人血液肿瘤微小残留监测模型在说明书摘要公布了:本发明提供一种用于人血液肿瘤微小残留监测模型,属于生物技术领域,包括:数据获取模块,用于接收治疗前和治疗后的DNA测序数据;有核细胞数获取模块,用于获取有核细胞数;克隆图谱及序列获取模块,用于获取克隆图谱以及对应的序列;融合基因型及序列获取模块,用于获得融合基因型以及对应的序列;计算模块,用于计算克隆频率、克隆细胞含量、融合频率以及融合细胞含量,并基于所述克隆频率、克隆细胞含量、融合频率以及融合细胞含量确定显著性克隆型和显著性融合型;MRD计算和判定模块,用于计算MRD值,并根据MRD值判定疾病的残留状态。仅需一轮PCR扩增即可获得文库,显著缩短建库时间,最低检出限能够达到10‑7。

本发明授权一种用于人血液肿瘤微小残留监测模型在权利要求书中公布了:1.一种用于人血液肿瘤微小残留监测模型,其特征在于,包括: 数据获取模块,用于接收同一检测对象治疗前和治疗后的DNA测序数据; 有核细胞数获取模块,用于将内参基因的测序数据比对到参考基因组获取有核细胞数; 克隆图谱及序列获取模块,用于通过比对算法将DNA测序数据比对到包括IGH、IGK和IGL基因的免疫数据库,然后通过聚类算法得到克隆图谱以及对应的序列; 融合基因型及序列获取模块,用于将DNA测序数据比对到参考基因序列,获得融合基因型以及对应的序列; 计算模块,用于基于所述有核细胞数、克隆图谱以及对应的序列、融合基因型以及对应的序列,计算克隆频率、克隆细胞含量、融合频率以及融合细胞含量,并基于所述克隆频率、克隆细胞含量、融合频率以及融合细胞含量确定显著性克隆型和显著性融合型; MRD计算和判定模块,用于根据同一对象治疗前后得到的克隆型和融合型,筛选有效的克隆型和融合型,并基于有效的克隆型和融合型所对应的克隆细胞含量和融合细胞含量计算MRD值,并基于MRD值判定人血液肿瘤的残留状态; 所述聚类算法包括: 基于所述DNA测序数据计算序列间的编辑距离; 基于所述编辑距离以及其与IGH基因V、D、J区,IGK基因V、J区和IGL基因V、J区之间的关系将测序出来的序列进行聚类分析,得出克隆图谱; 所述编辑距离的计算方式为: 其中,seq1和seq2表示2条测序得到的序列,i代表seq1中的第i个碱基,j代表seq2中的第j个碱基,i和j均从1开始,一直到最后一位,初始值均为0;ms表示匹配分值,当seq1的第i个碱基和seq2的第j个碱基序列一致时,mi,j值为正值;ss表示错配分值,当seq1的第i个碱基与seq2的第j个碱基序列不一致时,mi,j值为负值;os表示gap起始的分值,gapopening代表序列匹配出现gap的起始情况;es表示gap延续的分值;gapextending代表序列匹配出现gap的延续情况;S则表示clip分值,当seq1与seq2碱基高度不匹配,负值太高,此时会选择截断; ms、ss、os和es和S的取值满足下式: 其中,n为≥0的整数,且小于测序读长。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人北京泛生子基因科技有限公司;北京泛生子生物技术有限公司,其通讯地址为:102206 北京市昌平区中关村生命科学园生命园路8号院一区10号楼;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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