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深圳市早知道科技有限公司;深圳韦格纳医学检验实验室王理中获国家专利权

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龙图腾网获悉深圳市早知道科技有限公司;深圳韦格纳医学检验实验室申请的专利一种面向非独立基因数据的联邦分析方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119741976B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-15发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510241928.7,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权一种面向非独立基因数据的联邦分析方法是由王理中;宋洁;陈若言;李哲夫;唐森威;陈钢设计研发完成,并于2025-03-03向国家知识产权局提交的专利申请。

一种面向非独立基因数据的联邦分析方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种面向非独立基因数据的联邦分析方法,包括:S1、客户端对用户基因序列数据集进行身份加密与匿名化处理;S2、分别对表型数据和基因型数据进行预处理,并对标准化的基因型数据进行主成分分析;S3、采用回归模型,以根据研究目的确定的特定表型作为因变量,以其他所需特征和前5个主成分作为协变量,以基因位点基因型作为自变量,分别计算每个基因位点对特定表型的遗传效应值;S4、计算对应的样本的标识码列表,以及对照样本比例和病例比例;S5、主服务器采用联邦平均算法,对每个基因位点计算不同遗传效应值的方差矩阵和权重向量并聚合遗传效应值,从而解决了合并多个GWAS分析时的数据隐私问题以及样本重叠问题。

本发明授权一种面向非独立基因数据的联邦分析方法在权利要求书中公布了:1.一种面向非独立基因数据的联邦分析方法,其特征在于,利用主要由多个客户端和主服务器组成的面向非独立基因数据的联邦分析系统,包括如下步骤: S1、客户端采用标识码生成算法,对用户基因序列数据集进行身份加密与匿名化处理,得到匿名化的数据集; S2、基于匿名化的数据集,分别对表型数据和基因型数据进行数据预处理,得到标准化的表型数据集和基因型数据集,并对标准化的基因型数据进行主成分分析,得到前5个主成分; S3、基于标准化的表型数据集,在本地进行模型训练,选取模型训练中除基因型数据外的其他所需特征,并采用回归模型,以根据研究目的确定的特定表型作为因变量,以其他所需特征和前5个主成分作为协变量,以基因位点基因型作为自变量,分别计算每个基因位点对特定表型的遗传效应值,得到特定表型的GWAS数据; S4、基于特定表型的GWAS数据,计算对应的样本的标识码列表,以及对照样本比例和病例比例,得到客户端的数据集,并将其传输到主服务器; S5、主服务器基于来自多个客户端和自身的数据集,采用联邦平均算法,对每个基因位点计算不同遗传效应值的方差矩阵和权重向量,以及聚合遗传效应值; 所述S5中对每个基因位点计算不同遗传效应值的方差矩阵,包括如下步骤: 将任一个基因位点在多个客户端和主服务器数据集的不同遗传效应值记为,且,表示总共有个数据集,表示第个数据集,、、分别表示该基因位点在第1个、第个、第个数据集的遗传效应值; 将对应的不同遗传效应值的标准差记为,、、分别表示该基因位点在第1个、第个、第个数据集的遗传效应值的标准差; 将对应的不同遗传效应值的方差矩阵记为; 则方差矩阵中第行第列的值的计算公式为: 式中,该基因位点在表示第个数据集中的遗传效应值,且; ,,分别表示第个数据集的病例数、对照数和总样本数; ,,分别表示第个数据集的病例数、对照数和总样本数; ,分别表示第个和第个数据集中重合的对照数和病例数; 所述,的计算方法如下: 基于多个客户端传输的标识码列表和病例比例,通过对比标识码是否有重合,得到的总数,再分别乘以对应的对照样本比例和病例比例,得到和。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人深圳市早知道科技有限公司;深圳韦格纳医学检验实验室,其通讯地址为:518000 广东省深圳市福田区沙头街道车公庙天安创新科技广场A1002;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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