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申请/专利权人：浙江大学
申请日：2023-11-07
公开（公告）日：2024-02-02
公开（公告）号：CN117487930A
主分类号：C12Q1/6888
分类号：C12Q1/6888;C12Q1/6858
优先权：
专利状态码：在审-实质审查的生效
法律状态：2024.02.23#实质审查的生效;2024.02.02#公开
摘要：本发明公开了一种采用SNP分子标记的湖羊纯种评估方法，通过建立多因素线性回归模型，从30个遗传标记位点中选择16个显著的标记位点成功的预测了与湖羊群体代表性个体的IBS系数。通过矫正后的系数成功的预测了湖羊待检群体的纯种鉴定分类，其中73.7％的待检个体可以分类为纯种湖羊群体，14.7％的待检个体是湖羊低杂合的群体，11.53％的待检个体为高杂合度湖羊群体可以选择性的剔除。针对具有相同分类的群体，可以依据IBS系数的高低和留种的数量的选择性剔除个体。
主权项：1.一种采用SNP分子标记的湖羊纯种评估方法，其特征在于，包括以下步骤：1通过高通量测序的方法鉴定出湖羊群体具有特定群体频率的候选遗传变异，通过比较湖羊与其他群体遗传变异的频率建立评分并进行排序，依据遗传变异在羊群中存在的多种指标构建纯种评估模型，依据模型结果提供遗传标记候选集，根据位点引物设计以及位点的基因组的连锁情况选取30个遗传标记位点用于湖羊纯种鉴定；2步骤1得到的30个遗传标记位点采用SequenomSNP分型检测方法，通过plink软件利用分型的SNP数据计算IBS分数，所述IBS为状态同源，得到16个与IBS显著相关的遗传标记位点；3基于R语言，采用多因素线性回归模型，其中自变量为16个不同基因型的遗传标记位点，因变量为特定的IBS分数，通过建立的纯种评估模型对候选湖羊群体纯种群体进行纯种鉴定。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 浙江大学 一种采用SNP分子标记的湖羊纯种评估方法
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