申请/专利权人：中国科学院深圳先进技术研究院

申请日：2023-12-22

公开（公告）日：2024-04-26

公开（公告）号：CN117925676A

主分类号：C12N15/81

分类号：C12N15/81;C12N15/66;C07K14/245;C07K14/21;C07K14/035;C12N15/31;C12N15/38;C12N1/19;C12Q1/06;C12Q1/04;C12R1/865

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.05.14#实质审查的生效;2024.04.26#公开

摘要：本发明提供一种模块化正交真核转录因子模型构建方法，包括以下步骤：S1、确立转录因子基本架构DBD‑LBD‑AD；S2、构建结构域筛选载体和系统，筛选得到有效的DBD、LBD和AD；S3、筛选出DBD、LBD各结构域的对应参数；S4、根据DBD、LBD各结构域的对应参数来表征转录因子调控过程，建立转录调控定量模型；通过转录调控定量模型预测不同DBD和LBD组合情况下转录因子，获得性能优化的转录因子。本发明模块化正交真核转录因子模型构建方法，通过确定了模块化转录因子的基本架构，最终建立了转录调控定量模型，实现对转录因子进行模块化结构域参数优化，获得了性能优化的转录因子。

主权项：1.一种模块化正交真核转录因子模型构建方法，包括以下步骤：S1、确立由DNA结合结构域、配体结合结构域、转录激活结构域三种结构域组成的转录因子基本架构DBD-LBD-AD；S2、在转录因子基本架构DBD-LBD-AD基础上，分别构建DNA结合结构域、配体结合结构域、转录激活结构域三种结构域的筛选酿酒酵母菌株，然后对筛选酿酒酵母菌株进行筛选测试培养，筛选得到有效的DBD、LBD和AD；S3、在转录因子基本架构DBD-LBD-AD基础上，以筛选出的DBD、LBD分别构建用于结构域参数定量测试的定量测试酿酒酵母菌株；对定量测试酿酒酵母菌株进行定量测试培养，获得转录因子表达量下的调控诱导范围和调控倍数；对获得调控诱导范围和调控倍数数据进行拟合，得到筛选出的DBD、LBD各结构域的对应参数；S4、根据DBD、LBD各结构域的对应参数来表征转录因子调控过程，建立转录调控定量模型；通过转录调控定量模型预测不同DBD和LBD组合情况下转录因子，获得性能优化的转录因子。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 中国科学院深圳先进技术研究院 一种模块化正交真核转录因子模型构建方法

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