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桑花叶型矮缩相关双生病毒的LAMP检测引物组及其可视化检测方法 

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申请/专利权人:中国农业科学院植物保护研究所

摘要:本发明公布了一种桑花叶型矮缩相关双生病毒的LAMP检测引物组及其可视化检测方法,用于桑花叶型矮缩相关双生病毒的特异性检测。该检测引物组是根据桑花叶型矮缩相关双生病毒编码的V2基因序列设计,V2基因序列如SeqIDNO:1所示,包括以下三组引物:FIP、BIP、F3、B3、LF、LB,序列分别为SEQIDNO:2~7所示。通过DNA提取、LAMP恒温扩增后显色反应或琼脂糖凝胶电泳后可产生阶梯状条带。本发明针对桑花叶型矮缩相关双生病毒建立的可视化检测方法具有扩增快速高效、特异性好、操作简便、不需要特殊仪器等优点,为桑花叶型矮缩相关双生病毒防治提供技术依据。

主权项:1.一种LAMP检测引物组的桑花叶型矮缩相关双生病毒的可视化检测方法,其特征在于,LAMP检测引物组为基于MMDaVV2基因序列设计的三组引物,其中,V2基因序列如SeqIDNO:1所示;引物组如下所示:FIP:5'-GACTCGAACAGTCCTGGGCCT-CTGAGATCAAGGCGGGGA-3'BIP:5'-GTTGCAAGTGCCATGCGAACC-GGCCGTCTCTTCCTTCTTG-3'F3:5'-TGATTACCAGGAGCTCTGCT-3'B3:5'-GTTTCACTGGGCCCAACG-3'LF:5'-CCGTGGAATGGTTCCTGGATTC-3'LB:5'-CGTGGAGAAGAAGAGGCCCAAG-3';序列分别如SEQIDNO:2-7所示;包括以下步骤:(1)植物总DNA的提取:采用CTAB方法从采集的感染桑花叶型矮缩相关双生病毒的桑树中提取植物基因组总DNA;(2)LAMP反应:以该植物基因组总DNA为模板,采用所述的LAMP检测引物组进行LAMP反应;(3)LAMP产物显色反应:在LAMP产物中加入SYBRGreenI染料,拍照记录,有绿色荧光的判断为阳性,显示黄棕色的为阴性;(4)LAMP产物琼脂糖凝胶电泳分析:取5μL显色过的样品,用1.5%琼脂糖凝胶电泳分析,有阶梯状条带的判断为阳性,无条带的为阴性。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国农业科学院植物保护研究所 桑花叶型矮缩相关双生病毒的LAMP检测引物组及其可视化检测方法

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