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【发明公布】一种基于CrRNA封闭改造检测单碱基突变的方法_博迪泰(厦门)生物科技有限公司;广州胜全生物技术有限公司_202410150693.6 

申请/专利权人:博迪泰(厦门)生物科技有限公司;广州胜全生物技术有限公司

申请日:2024-02-02

公开(公告)日:2024-05-07

公开(公告)号:CN117987513A

主分类号:C12Q1/6827

分类号:C12Q1/6827;C12Q1/682;C12N15/113;C12N15/11

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.05.24#实质审查的生效;2024.05.07#公开

摘要:本发明提供一种基于CrRNA封闭改造检测单碱基突变的方法,该方案对CrRNA进行封闭,前期反应不受早期Cas12a活性的影响。通过对单碱基突变引入碱基错配,区分单碱基突变,同时设计的HP探针不仅可以打开封闭的CrRNA还能将待检测的靶标序列重新释放出来进入循环,这种级联放大效应提高CRISPRCas12a的灵敏度。由于单碱基突变的野生型和突变型的HP探针和CrRNA均是特异性的,因此可以灵敏、快速有效的区分单碱基突变的野生型、突变型和杂合型。

主权项:1.一种基于CrRNA封闭改造检测单碱基突变的方法,其特征在于:该方法包括针对单碱基突变的野生型和突变型各设计一条与靶标核酸存在一个碱基错配的互补序列特异性HP探针,靶标序列作为HP探针的开关,在无靶标时HP探针呈发夹结构,且在3’端有一个粘性末端;针对野生型和突变型的HP探针各设计一条改造的特异性CrRNA,改造的CrRNA设计为在常规的CrRNA的3’端延长一段序列,该序列部分封闭CrRNA的活性,且在3’端有一个粘性末端;在特异性靶标存在时特异性的HP探针发夹结构打开,暴露出的序列匹配上CrRNA粘性末端序列,根据链置换反应原理打开处于封闭状态CrRNA,同时与HP探针匹配的靶标序列被替换出来,再次去打开封闭状态的HP探针,以此形成循环,并且HP探针修饰有荧光报告基团,随着循环的进行产生荧光信号;在CRISPR-Cas12a体系下CrRNA打开后与人为添加ssDNA识别,激活Cas12a的附属切割活性,切割报告探针P,再次产生大量荧光信号。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 博迪泰(厦门)生物科技有限公司;广州胜全生物技术有限公司 一种基于CrRNA封闭改造检测单碱基突变的方法

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