申请/专利权人：武汉双绿源创芯科技研究院有限公司;青岛双绿源依诺科技有限公司

申请日：2022-12-20

公开（公告）日：2024-06-11

公开（公告）号：CN118166138A

主分类号：C12Q1/6895

分类号：C12Q1/6895;C12N15/11;C12Q1/6869

优先权：["20221210 CN 2022115888443"]

专利状态码：在审-公开

法律状态：2024.06.11#公开

摘要：本发明基于2058个水稻品种中8584244个SNP位点信息，获得抗旱基因DROT1功能SNP位点上下游各250Kb区域内的共计8025个SNP的基因型信息，通过连锁不平衡分析，筛选出2组与水稻抗旱基因DROT1紧密连锁的单倍型标记，这2组单倍型分子标记可用于水稻抗旱基因DROT1的功能鉴定，有效避免了因少数标记检测失败而导致的鉴定精准性问题，以及由于基因附近发生重组而导致的基因功能丧失的问题，提高功能基因鉴定的精准性。

主权项：1.单倍型分子标记1在鉴定水稻抗旱基因DROT1中的应用，其特征在于，所述单倍型分子标记1由16个SNP位点组成，SNP位点信息如下：SNP1所在基因组位置为Chr10：18976403bp；SNP2所在基因组位置为Chr10：18980812bp；SNP3所在基因组位置为Chr10：18980922bp；SNP4所在基因组位置为Chr10：18981003bp；SNP5所在基因组位置为Chr10：18981136bp；SNP6所在基因组位置为Chr10：18982105bp；SNP7所在基因组位置为Chr10：18985716bp；SNP8所在基因组位置为Chr10：18989250bp；SNP9所在基因组位置为Chr10：18994060bp；SNP10所在基因组位置为Chr10：18994938bp；SNP11所在基因组位置为Chr10：18995627bp；SNP12所在基因组位置为Chr10：18995924bp；SNP13所在基因组位置为Chr10：18995932bp；SNP14所在基因组位置为Chr10：18996000bp；SNP15所在基因组位置为Chr10：18999388bp；SNP16所在基因组位置为Chr10：19001572bp；以上SNP标记基于位置由小到大依次组成的单倍型为TAACTTTTAAGTTCCT，则含有抗旱基因DROT1，DROT1基因的功能位点基因型为T，SNP位点的物理位置是基于日本晴的全基因组序列MSU7.0版本确定。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 武汉双绿源创芯科技研究院有限公司;青岛双绿源依诺科技有限公司 与水稻抗旱基因DROT1紧密连锁的分子标记

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