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申请/专利权人：湖北伯远合成生物科技有限公司
摘要：本发明公开了一种快速分析CRISPRCas9基因编辑载体构建情况的方法，包括如下步骤：S1、基于靶标区间设计载体通用引物，扩增，构建文库，送高通量测序，得到测序数据；S2、对步骤S1中得到的测序数据进行质控；S3、对步骤S2中得到的质控后的数据进行两端reads的拼接，获得长序列数据；S4、根据靶标区间前后的载体序列是已知、并且相同的特点，对步骤S3中获得的长序列数据进行分析，然后将靶标区间序列提取出来，进行统计分析，从而可以获得靶标的构建情况；该方法快速精准、成本低廉，可以多样品混合测序，鉴定成千上万个基因编辑载体，只需要1G的数据量即可以满足分析需求，因此，在植物、动物或微生物载体构建中的应用领域具有良好的应用前景。
主权项：1.一种快速分析CRISPRCas9基因编辑载体构建情况的方法，其特征在于，包括如下步骤：S1、基于靶标区间设计载体通用引物，扩增，构建文库，送高通量测序，得到测序数据；S2、对步骤S1中得到的测序数据进行质控；S3、对步骤S2中得到的质控后的数据进行两端reads的拼接，获得长序列数据；S4、根据靶标区间前后的载体序列是已知、并且相同的特点，对步骤S3中获得的长序列数据进行分析，然后将靶标区间序列提取出来，进行统计分析，从而可以获得靶标的构建情况；靶标区间序列提取方法如下：S41、靶标前后端序列识别：选取靶标前后端的序列长度在18～30bp之间，采用完全匹配形式定位到靶标前后的序列位置上；S42、标记的添加：分别在步骤S41中识别到的靶标前后端序列上添加一段标记字符，使靶标带上独特的标记；S43、提取靶标序列：根据步骤S42中的标记字符，提取出靶标序列，并完成统计计数。
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百度查询： 湖北伯远合成生物科技有限公司 一种快速分析CRISPR/Cas9基因编辑载体构建情况的方法及应用
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