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一种基于光控的CRISPR-Cas核酸检测试剂盒及检测方法 

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申请/专利权人:华南师范大学

摘要:本发明公开了一种基于光控的CRISPR‑Cas核酸检测试剂盒及检测方法,该试剂盒包括沉默引导RNA和Cas蛋白;沉默引导RNA是由沉默核苷酸和引导RNA通过退火杂交形成;引导RNA是根据靶标核酸序列设计的,包含重复区和间隔区两个区域;沉默核苷酸与引导RNA的间隔区序列完全互补配对,或者与引导RNA的重复区序列完全配对;沉默核苷酸的碱基之间采用PClinker连接;Cas蛋白为Cas12蛋白或Cas13蛋白。本申请将核酸扩增和CRISPR‑Cas检测在时间上分开,但是可以实现在一个试管里面封闭完成,避免了开盖试剂转移过程,在确保高的检测灵敏度的同时,又保证了检测不受气溶胶污染影响。

主权项:1.一种基于光控的CRISPR-Cas和RPA等温扩增的检测方法,其特征在于:所述的检测方法为非疾病诊断的检测方法,包括以下步骤:(1)将沉默引导RNA、Cas蛋白、荧光报告探针、扩增引物、酶与缓冲液混合配制成预混反应液,加入包含靶标核酸的待测物形成单管内的混合体系;(2)将上述混合体系进行等温扩增,待等温扩增完成,启动UV光照,连接子断裂,沉默核苷酸从引导RNA上脱离,CRISPR-Cas核酸切割反应启动,最后检测所述混合体系中的荧光信号;其中,所述的沉默引导RNA,是由沉默核苷酸和引导RNA通过退火杂交形成;所述引导RNA是根据靶标核酸序列设计的,包含重复区和间隔区两个区域;所述沉默核苷酸与引导RNA的间隔区序列完全互补配对,或者与引导RNA的重复区序列完全配对;所述沉默引导RNA的碱基之间采用可被光激活降解的PClinker连接;所述沉默核苷酸与引导RNA的摩尔浓度比为2:1;所述荧光报告探针为FQC6,序列为FAM-CCCCCC-BHQ1;其中,所述的Cas蛋白为Cas12蛋白,所述的引导RNA如SEQIDNO.1所示,所述的沉默RNA的序列为:uguaau-PClinker-ggaccu-PClinker-caaacc-PClinker-ccaucua,所述的扩增引物为SEQIDNO.36和SEQIDNO.37;或,所述的Cas蛋白为Cas12蛋白,所述的引导RNA如SEQIDNO.38所示,所述的沉默RNA序列为:gugguu-PClinker-uguaug-PClinker-aaauca-PClinker-ccaucua,所述的扩增引物为SEQIDNO.39和SEQIDNO.40;或,所述的Cas蛋白为Cas12蛋白,所述的引导RNA如SEQIDNO.41所示,所述的沉默RNA序列为:gaacgc-PClinker-ugaagc-PClinker-gcuggg-PClinker-ggaucua,所述的扩增引物为SEQIDNO.42和SEQIDNO.43。

全文数据:

权利要求:

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