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一种牛MFSD13A基因上游21bp与19bp两个indel多态性的快速检测方法及其应用 

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申请/专利权人:河南省农业科学院畜牧研究所

摘要:本发明公开了一种牛MFSD13A基因启动子区完全连锁平衡的21bp与19bp两个indel多态性的快速检测方法及其应用,属于分子遗传学领域。其中检测方法包括:根据在MFSD13A基因启动子区存在的21bp和19bp两个indel插入这一特征,设计该位点的上下游引物用P表示。对将检测的不同品种牛进行颈静脉采血,提取基因组DNA,用引物对P进行PCR扩增,最后通过琼脂糖凝胶电泳检测该基因两种indel多态性,当存在21bp与19bp两个indel共计40bp插入时为II基因型,40bp缺失时为DD基因型,该位点为杂合个体时,为ID基因型。同时,本发明还对不同品种牛的基因型分布及等位基因频率进行了分析,并与南阳牛、夏南牛群体的生长、体尺性状进行关联性分析,用于牛的辅助选择和分子育种。

主权项:1.一种用于检测牛MFSD13A基因上游21bp与19bp两个indel多态性的快速检测方法,其特征在于,主要包括以步骤:1根据牛MFSD13A基因启动子区的基因序列,设计一对引物P:上游引物P-F:5’-TGGATTGGGGGTGGTGTTTT-3’;下游引物P-R:5’-CTGTGCTGTGTCATGGGACT-3’。2以包含牛MFSD13A基因的序列为模板,利用步骤1设计的引物,进行PCR扩增;3通过琼脂糖凝胶电泳检测牛MFSD13A基因的核苷酸多态性,当在启动子区包含两个indel插入时,扩增产物为一条带,条带大小为271bp,命名为II基因型;当在启动子区发生两个indel缺失时,扩增产物为一条带,条带大小为231bp,命名为DD基因型;当两位点为杂合的个体时,扩增产物为两条带,条带大小分别为271bp和231bp,命名为ID基因型。

全文数据:

权利要求:

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