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申请/专利权人：屈晓超
摘要：本发明属于网络药理学领域，提供了一种基于网络药理学分析治疗多种癌的药物预测方法。包括以下步骤：在线网站下载癌症的转录组数据、数据预处理、差异表达分析、获取差异表达的交集基因、获得蛋白质相互作用网络、关键基因的筛选及获取以及药物预测。本发明运用高通量整合分析技术的网络药理学分析技术，具有药物筛选操作简单、速度快、筛选信息全的特点，可辅助用于疾病治疗，实现公共资源互换及资源的高效整合利用，具有科学依据性和较好的应用价值和市场前景。
主权项：1.一种基于网络药理学的针对多种癌症治疗的药物预测方法，包括如下步骤：1多种癌症的转录组数据收集：为了确定多种不同癌症的相关基因，我们从癌症基因组数据库设置筛选条件，按照需求选择疾病类型，获得不同癌症患者的转录组数据集；2癌症转录组数据预处理：利用perl语言脚本文件和R语言脚本文件将转录组数据中gene_id转换为gene_symbol进行规范；3癌症差异基因（DEGs，Differentialexpressedgenes）鉴定：预处理后的癌症转录组数据借助R语言的edgeR包分析表达矩阵，获取癌症差异基因；4不同癌症差异基因间共同靶点筛选：在韦恩图在线网站jvenn中输入不同癌症各自的DEGs，获取多种不同癌症DEGs的共同靶点；5蛋白互作（PPI）网络构建：在STRING数据库中检索某种癌症的所有DEGs或不同癌症DEGs的共同靶点，设置筛选条件，构建PPI网络，找到TSV文件并下载；6核心靶点筛选及获取：借助Cytoscape（v3.8.2）的cytoHubba插件来识别关键基因，根据靶点间相互作用强度筛选得到核心靶点（Hub）；7药物预测：使用DSigDB数据库获取靶向癌症关键基因（Hub）的药物。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 屈晓超 一种基于网络药理学的针对多种癌症治疗的药物预测方法
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