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一个以老化基因预测POP的随机森林模型 

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申请/专利权人:南京大学

摘要:本发明涉及遗传学领域,公开了一个以老化基因预测POP的随机森林模型,包括测序与数据生成模块、数据处理与分析模块、特征选择与模型构建模块、模型验证与输出模块;所述测序与数据生成模块用于从组织样本中提取RNA,并进行转录组高通量测序,生成原始测序数据;所述数据处理与分析模块用于处理测序数据,包括质量控制和数据比对,生成用于分析的基因表达矩阵;所述特征选择与模型构建模块筛选与老化相关的基因作为特征变量,并利用这些变量构建随机森林模型。通过使用老化基因作为特征变量预测POP,有效地将疾病预测与老龄相关生物标志物关联,从而不仅增强了疾病预测的准确性,还为开发针对性治疗提供了重要靶点。

主权项:1.一个以老化基因预测POP的随机森林模型,其特征在于,包括测序与数据生成模块、数据处理与分析模块、特征选择与模型构建模块、模型验证与输出模块;所述测序与数据生成模块用于从组织样本中提取RNA,并进行转录组高通量测序,生成原始测序数据;所述数据处理与分析模块用于处理测序数据,包括质量控制和数据比对,生成用于分析的基因表达矩阵;所述特征选择与模型构建模块筛选与老化相关的基因作为特征变量,并利用这些变量构建随机森林模型;所述模型验证与输出模块用于验证模型的预测效果,并输出预测结果和性能指标。

全文数据:

权利要求:

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