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基于OpenSeadragon框架的病理标注系统 

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申请/专利权人:神州医疗科技股份有限公司

摘要:本申请公开了一种基于OpenSeadragon框架的病理标注系统,包括病理图像显示平台、病理标注平台和数据存储平台,病理图像显示平台包括数据请求模块、图像获取模块和图像加载模块;数据请求模块用于向所述病理标注平台发送数据请求,生成目标病理图像;图像获取模块用于采用OpenSlide将目标病理图像转为DeepZoom图像;图像加载模块用于根据需求加载所述DeepZoom图像,进行病理图像展示;病理标注平台用于处理所述数据请求,并将响应结果返回至所述数据请求模块;数据存储平台用于存储用户数据、病理图像数据、标注数据以及业务流程数据。本发明根据病理科研的实际需求设计病理标注系统,标注灵活、效率高,标注数据的质量得到提升。

主权项:1.基于OpenSeadragon框架的病理标注系统,其特征在于,包括病理图像显示平台、病理标注平台和数据存储平台,所述病理图像显示平台包括数据请求模块、图像获取模块和图像加载模块;所述数据请求模块用于向所述病理标注平台发送数据请求,生成目标病理图像;所述图像获取模块用于采用OpenSlide将所述目标病理图像转为DeepZoom图像,所述DeepZoom图像经过模糊分层和图元切分建立一个空间上的拓扑结构,将完整图像多次模糊化之后产生分辨率从高到低的层级,然后将每个层级的图像切割为大小规则的图元,将完整的静态图像拓展为三维空间上不同方位不同分辨率的拓扑结构,在进行可视化显示时根据具体的清晰度和位置需求来取出部分图元进行拼接渲染;所述图像获取模块包括:读取单元、金字塔单元、切片单元和组织单元;所述读取单元用于读取数字病理学图像文件,将其转化为OpenSlide的内部数据格式;所述金字塔单元用于根据用户指定的参数,对图像进行裁剪、缩放操作,生成多个不同分辨率的图像金字塔;所述切片单元用于对所述图像金字塔进行切片,生成图片文件;所述组织单元将所述图片文件按照DZI格式进行组织,生成DZI文件;所述图像加载模块用于根据需求加载所述DeepZoom图像,进行病理图像展示;所述病理标注平台用于处理所述数据请求,并将响应结果返回至所述数据请求模块;所述病理标注平台基于JAVA、Springboot、Mybatis构建,包括数据分配模块、业务处理模块和数据交互模块;所述数据分配模块用于通过所述Springboot分配所述数据请求,并对所述数据请求进行JSON解析;所述业务处理模块用于通过所述JAVA进行业务逻辑处理,实现图像解析、图像转换、标注绘制、标注存储功能;所述数据交互模块用于通过所述Mybatis与所述数据存储平台进行交互;所述数据存储平台用于存储用户数据、病理图像数据、标注数据以及业务流程数据。

全文数据:

权利要求:

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