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一种微生物单细胞CRISPR筛选多组学测序的建库方法 

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申请/专利权人:南京派森诺基因科技有限公司

摘要:本发明提供了一种微生物单细胞CRISPR筛选多组学测序的建库方法,主要涉及以下步骤:采用一种基于CRISPRCas9系统的基因批量敲除方法制备微生物细胞sgRNA池;对微生物细胞sgRNA池进行微生物细胞的固定,获得固定后的细胞悬液;对固定后的细胞悬液进行透化处理以便后期微生物细胞在油包水结构中裂解进行反转录;在现有10X微流控平台的基础上替换试剂优化反转录体系,制备中间产物cDNA;对中间产物cDNA进行两次不同方式的建库,一种是基于10X平台的微生物单细胞测序的建库方法,另一种是直接对中间产物cDNA进行二步法扩增的建库方法;本发明的方法巧妙地利用两种建库方式构建文库之间的相关性,来进行微生物单细胞CRISPR筛选多组学测序的相关生信分析。

主权项:1.一种微生物单细胞CRISPR筛选多组学测序的建库方法,其特征在于,包括以下步骤:1采用一种基于CRISPRCas9系统的基因批量敲除方法制备微生物细胞sgRNA池;2对微生物细胞sgRNA池进行微生物细胞的固定,获得固定后的细胞悬液;3对固定后的细胞悬液进行透化处理以便后期微生物细胞在油包水结构中裂解进行反转录;4在现有10X微流控平台的基础上替换试剂优化反转录体系,制备中间产物cDNA;5对中间产物cDNA进行两次不同方式的建库,一种是基于10X平台的微生物单细胞测序的建库方法,另一种是直接对中间产物cDNA进行二步法扩增的建库方法;6磁珠纯化即可得到原始的测序文库。

全文数据:

权利要求:

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