龙图腾网&IPTOP
- 微信扫码登录
- 账号密码登录
- 短信登录/注册
买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！
申请/专利权人：华南农业大学;广州瑞科基因科技有限公司
摘要：本发明公开了一种籼粳稻SNP位点基因型检测的方法，涉及生物技术领域。通过对水稻全基因组进行超低深度测序，获取核心SNP位点的基因型，经过近距离SNP的基因型组成分析，校正后，综合判定核心SNP位点的基因型。本发明提供的方法可以在超低的测序深度2‑10倍下实现高达90％的检测正确率。极大程度上降低了抽样数量，降低了工作量，优化了测试区域，使得检测结果更为准确。
主权项：1.一种籼粳稻SNP位点基因型检测的方法，其特征在于，其包括：将待测样本的DNA进行全基因组高通量测序，然后分析获取核心SNP位点的基因型；再对上述SNP位点的基因型进行校正；所述待测样本为水稻；所述全基因组高通量测序的测序深度为2倍-10倍基因组大小的测序数据；所述核心SNP位点是指：在获得籼稻样品群体，或者粳稻样品群体水稻样品的SNP位点的基础上，计算SNP候选位点在群体中的杂合度分数Hp，将小于Hp设定阈值的位点作为标记为核心SNP位点；所述校正包括：检测在染色体序列的上游100Kb和下游100Kb范围内SNP位点的基因型，计算该范围内基因型的分布情况，进行SNP位点基因型的校正；上下游100Kb范围内基因型的分布情况由如下所示的公式计算： ；Pi为位点i的基因型概率，Pi-2|i-3表示为在已知Pi-3的概率下，Pi-2的条件概率；Pi的概率等于上下游100Kb范围内的SNP位点的条件概率的乘积。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 华南农业大学 广州瑞科基因科技有限公司 一种籼粳稻SNP位点基因型检测的方法
免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。
主营中国专利交易买卖与专利转让许可,高校科技成果推广与科技成果转化,知识产权运营管理与平台开发,科技人才专家库与科技猎头等科技服务
开放平台
担保交易
惠及多方
会员特惠
专属平台
适合多方
数据共享
功能齐全
皖公网安备 34010402703815号