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基于Hi-C技术和多组学联合分析挖掘绵羊骨骼肌卫星细胞增殖分化相关基因的方法 

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申请/专利权人:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

摘要:本发明涉及生物技术领域,具体涉及基于Hi‑C技术和多组学联合分析挖掘绵羊骨骼肌卫星细胞增殖分化相关基因的方法。本发明结合Hi‑C技术与多组学分析方法提供一种挖掘绵羊骨骼肌卫星细胞发育相关基因的方法,该方法可实现利用染色体三维结构差异鉴定方法联合染色质可及性图谱、表观修饰图谱和转录组基因表达水平差异分析高效挖掘参与骨骼肌卫星细胞发育的功能基因。本发明的方法不仅有利于阐明绵羊骨骼肌卫星细胞增殖分化调控机制,而且对肉用绵羊产肉性状的分子育种和品种改良具有重要促进作用,具有较好的应用价值。

主权项:1.基于Hi-C技术和多组学联合分析挖掘绵羊骨骼肌卫星细胞增殖分化相关基因的方法,其特征在于,所述方法包括:分别构建增殖期和分化期的绵羊骨骼肌卫星细胞Hi-C文库并进行测序,得到Hi-C数据;对Hi-C数据进行处理,鉴定TAD及其差异以及染色质环及其差异;基于RNA-seq、ATAC-seq和CUTTag技术进行多组学数据分析,鉴定与骨骼肌发育相关的基因和远程调控元件;其中,RNA-seq技术用于分析基因表达情况,ATAC-seq技术用于鉴定染色质可及性,CUTTag技术用于鉴定H3K4me3、H3K27ac和H3K27me3组蛋白表观修饰。

全文数据:

权利要求:

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