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基于距离信号输出的靶核酸即时检测方法 

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申请/专利权人:杭州孚斯泰生物技术有限公司

摘要:本发明提供了一种基于距离信号输出的靶核酸即时检测方法,具体包含一种CRISPRCas12响应的DNA智能水凝胶和基于距离信号输出的纸基微流控芯片。反应流程包括:1对待测样品中的总核酸进行提取;2借助等温扩增技术对核酸检测片段进行扩增;3通过CRISPRCas12a体系对扩增片段进行识别,利用其核酸酶活性对DNA智能水凝胶进行切割,并释放其中包埋的信号分子;4借助纸基微流控芯片上的级联酶反应对信号进行转导,最终借助芯片上色柱的距离信号进行检测结果的读取。该方法操作便携,无需大型仪器辅助,成本低廉,且保持了传统CRISPRCas12体系选择性好、灵敏度高的优点,具有应用前景。

主权项:1.一种非诊断目的的基于距离信号输出的靶核酸即时检测方法,其特征在于,包括如下检测步骤:步骤一:对待测样品中的总核酸进行提取;步骤二:借助核酸扩增技术对待测样品中的靶核酸片段进行扩增;步骤三:在crRNA的介导下,Cas12a核酸酶特异性识别扩增产物中的靶核酸片段,利用其核酸酶活性对预先制备的DNA智能水凝胶进行切割,释放其中包埋的信号分子,并与其相应的底物进行反应;步骤四:借助纸基微流控芯片上的级联酶反应对信号进行转导,借助芯片上色柱的距离信号进行检测结果的读取;所述的DNA智能水凝胶由具备相同黏性末端的分支型骨架DNA和分支型交联剂DNA经自组装形成;分支型骨架DNA和分支型交联剂DNA由单链DNA部件经分子内间杂交而形成;所述分支型骨架DNA为Y型骨架DNA,所述分支型交联剂DNA为L型交联剂DNA,二者自组装形成水凝胶,Y型骨架所使用的单链DNA部件为Y1、Y2、Y3,L型交联剂所使用的单链DNA部件为L1、L2;Y1、Y2、Y3单链DNA部件浓度为400μM-800μM,L1、L2单链DNA部件浓度为250μM-550μM,具体序列为:Y1,即SEQIDNo.1序列:5’-CGATTGACCACGCTGTCCTAACCATGACCGTCGAAG-3’Y2,即SEQIDNo.2序列:5’-CGATTGACCTTCGACGGTCATGTACTAGATCAGAGG-3’Y3,即SEQIDNo.3序列:5’-CGATTGACCCTCTGATCTAGTAGTTAGGACAGCGTG-3’L1,即SEQIDNo.4序列:5’-GTCAATCGTTATTATTATTTCTATTCGCATGAGGATCCCAT-3’L2,即SEQIDNo.5序列:5’-GTCAATCGTTATTATTATTATGGGATCCTCATGCGAATAGA-3’;水凝胶所包埋的信号分子为:具有催化水解产生葡萄糖功能的产糖酶,借助其催化活性将相应的反应底物水解产生葡萄糖;所述的信号分子包括:淀粉酶,转化酶,半乳糖苷酶,葡聚糖酶,其相应的反应底物包括:淀粉,蔗糖,乳糖,葡聚糖;所使用的纸基微流控芯片至少存在一个上样区与一个矩形通道;上样区吸附有葡萄糖氧化酶、辣根过氧化物酶,矩形通道吸附有二氨基联苯胺;步骤四中,葡萄糖氧化酶用量为0.5-5U,辣根过氧化物酶用量为0.5-5U,二氨基联苯胺浓度为5-20mgmL。

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