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一种基于邻位效应诱导的级联扩增检测方法及其应用 

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申请/专利权人:贵州医科大学

摘要:本发明提供了一种基于邻位效应诱导的级联扩增检测方法,包括AuNPs、Pt@AuNPs、DNA‑Pt@AuNPs、cDNA1和cDNA2的制备,捕获界面的构建,靶标外泌体的提取和检测。该方法用于外泌体的检测,用于临床乳腺癌病人血液样本分析。本发明基于邻位效应诱导的强大扩增级联,使用纳米酶作为信号标记,进行比色分析方法,可用于准确和高灵敏度地检测肿瘤来源的外泌体。

主权项:1.一种基于邻位效应诱导的级联扩增检测方法,其特征在于,该方法为:S1、AuNPs的制备:将40mL2.2mM柠檬酸钠溶液加入到干净的锥形烧瓶中,并在100℃的水浴环境中搅拌5min,然后加入267μL的25mMHAuCl4进行反应10min,将反应温度调节至90℃;然后以2s的间隔依次加入267μL60mM柠檬酸钠溶液和267μL25mMHAuCl4溶液,继续重复上述以2s的间隔依次加入267μL60mM柠檬酸钠溶液和267μL25mMHAuCl4溶液的操作30min,得到含金纳米颗粒的溶液,即AuNPs溶液,冷却后,避光储存在4℃;S2、铂包金纳米粒子Pt@AuNPs的制备:将S1中得到的16mLAuNPs溶液在90℃水浴中加热5min,然后以20μLmin的速率加入694μL1.0mMNa2PtCl6溶液,再以20μLmin的速率加入8mL4.0mML-抗坏血酸,反应30min后,得到含铂包金纳米粒子的溶液,即Pt@AuNPs溶液,冷却至25℃,避光保存;S3、DNA-Pt@AuNPs的制备:将10μL100μMBindingStrand和200μL的S2中得到的Pt@AuNPs溶液混合,并在-20℃下冷冻3h,在室温下解冻后,将混合物以11500rpm离心10min后,将沉淀物用PBS缓冲液洗涤3次,将产物重新分散在PBS中,得到DNA-Pt@AuNPs,4℃条件下避光保存;所述BindingStrand的序列为:SH-AAAAAAGCCTGTACCTAGTTTAT;S4、cDNA1和cDNA2的制备:S401、cDNA1:将L1和PS1放入Tris-HCl缓冲液中,得到L1和PS1的混合液,95℃退火10min,自然冷却至室温,然后L1PS1双链的缺口通过孵育30UT4DNA连接酶过夜来密封,然后70℃灭活10min,加入100U核酸外切酶I和100U核酸外切酶III,37℃孵育60min,80℃灭活15min,得到cDNA1;所述L1和PS1的混合液中L1的浓度为12μM,PS1的浓度为10μM;所述L1的核苷酸序列如SEQIDNO:1所示;所述PS1的序列为:P'-GTGCCTGTACCTAGTTATACCCATCGCCCTACTTATTACGCTCATGTATTAAAAAATGC;S402、cDNA2:将L2和PS2放入Tris-HCl缓冲液中,得到L2和PS2的混合液,95℃退火10min,自然冷却至室温,然后L2PS2双链的缺口通过孵育30UT4DNA连接酶过夜来密封,然后70℃灭活10min,加入100U核酸外切酶I和100U核酸外切酶III,37℃孵育60min,80℃灭活15min,得到cDNA2;所述L2和PS2的混合液重L2的浓度为12μM,PS2的浓度为10μM;所述L2的核苷酸序列如SEQIDNO:2所示;所述PS2的序列为:P'-CCCAATATCATCAAAAAAAAATACATGAGCGTAATAAAAACAACCCCAGATAAG;S5、捕获界面的构建:在37℃的条件下,将BS和链霉亲和素包被的96孔板一起孵育2h,加入聚合酶缓冲液a继续孵育40min触发RCA反应,最后用Tri-HCl冲洗平板2次,得到捕获界面;所述聚合酶缓冲液a中含有1mMdNTP、10Uphi29聚合酶、1×DNA聚合酶缓冲、1μMS402中得到的cDNA2;所述BS的序列为:Biotin-TTTTTTTTTTTGATGATATTGGGCTTATCTGGGGTTGT;S6、外泌体的提取:在37℃下保持在含有5%CO2环境中,分别将MCF-10A,Hela,HepG2以及MCF-7在DMEM培养基中细胞培养48h后,然后5000g离心10min,10000g离心30min,收集细胞上清液,通过0.22μm孔径的膜过滤获得的上清液120000g离心70min,得到的沉淀物质,即为外泌体,用无菌PBS缓冲液洗涤后,-80℃下储存;S7、外泌体的检测:将S6中得到的外泌体稀释至不同丰度并与AP1TS、AP2、HP1、HP2、HP3混合,放入含MgCl2的Tris-HCl缓冲溶液中反应120min,然后加入S3中得到的DNA-Pt@AuNPs、聚合缓冲液b,得到反应液,室温保持120min;然后将所述反应液与S5中得到的捕获界面孵育30min,用PBS冲洗后,将板进一步与50μLTMBH2O2显色底物孵育以进行过氧化反应30min,最后引入50μL的2MH2SO4溶液终止过氧化反应,通过紫外-可见光谱测量吸光度,通过比色信号对所述外泌体进行定量分析;所述AP1TS为AP1探针和TS探针按1:1的杂交产物;所述聚合缓冲液b中含有1mM的dNTP、10Uphi29聚合酶、1×DNA聚合酶缓冲、3μM的S401中得到的cDNA1;所述反应液中以下各物质的浓度:AP1TS、AP2、HP1、HP2、HP3的浓度均为1μM,MgCl2的浓度为20mM;所述AP1TS中AP1的核苷酸序列如SEQIDNO:3所示;所述AP1TS中TS的核苷酸如SEQIDNO:4所示;所述AP2的核苷酸序列如SEQIDNO:5所示;所述HP1的核苷酸序列如SEQIDNO:6所示;所述HP2的核苷酸序列如SEQIDNO:7所示;所述HP3的核苷酸序列如SEQIDNO:8所示。

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