龙图腾网&IPTOP
- 微信扫码登录
- 账号密码登录
- 短信登录/注册
买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！
申请/专利权人：云南大学
摘要：本发明涉及细胞聚类技术领域，公开了一种单细胞RNA测序数据聚类方法。本发明基于ZINB的自编码模块来提取单细胞RNA测序数据的内容信息，并通过ZINB解码重构基因表达矩阵以及数据分布；其次，利用图自编码模块捕获细胞之间的高阶结构信息，通过对细胞‑细胞图进行图卷积网络处理，提取细胞之间的结构信息；通过注意力融合机制将基于ZINB的自编码模块和图自编码模块进行逐层的融合嵌入，将基因表达信息的特征表示和结构信息有效地融合到同一个表示中，增强了聚类性能；最后，本发明采用自监督策略将基于ZINB的自编码模块和图自编码模块集成到一个统一的框架中，并有效地对这两个模块进行端到端的聚类训练和同步优化，从而提升了聚类性能。
主权项：1.一种单细胞RNA测序数据聚类方法，其特征在于，包括步骤：获取单细胞RNA测序数据，对所述单细胞RNA测序数据进行预处理，得到单细胞RNA基因表达矩阵X；根据所述单细胞RNA基因表达矩阵X，使用KNN方法构建细胞-细胞图邻接矩阵A；构建基于ZINB的自编码模块以及图自编码模块；将所述基于ZINB的自编码模块和图自编码模块通过注意力融合机制逐层连接，通过这种逐层嵌入的操作将基因表达信息的特征表示和细胞结构信息有效地融合到同一个表示中；通过自监督策略将基于ZINB的自编码模块和图自编码模块集成到一个统一的框架中，基于所述单细胞RNA基因表达矩阵X和细胞-细胞图邻接矩阵A对这两个模块进行端到端的聚类训练和同步优化，得到聚类预测模型；将待聚类的单细胞RNA测序数据进行处理后，得到待聚类的单细胞RNA基因表达矩阵X和细胞-细胞图邻接矩阵A，将其输入所述聚类预测模型，输出嵌入表示，根据所述嵌入表示得到预测的细胞类别并完成聚类。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 云南大学 一种单细胞RNA测序数据聚类方法
免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。
主营中国专利交易买卖与专利转让许可,高校科技成果推广与科技成果转化,知识产权运营管理与平台开发,科技人才专家库与科技猎头等科技服务
开放平台
担保交易
惠及多方
会员特惠
专属平台
适合多方
数据共享
功能齐全
皖公网安备 34010402703815号