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与MHC-肽靶标结合的抗原识别分子的脱靶预测方法 

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申请/专利权人:瑞泽恩制药公司

摘要:本发明提供了用于预测以与主要组织相容性复合体MHC分子的复合物MHC‑靶标肽复合物形式呈现的靶标肽内的氨基酸位置的计算系统和方法,所述氨基酸位置参与与识别所述MHC‑靶标肽复合物的抗原识别分子的相互作用。本发明提供了用于估计抗原识别分子的脱靶肽的数量的计算系统和方法,所述抗原识别分子识别以与主要组织相容性复合体MHC分子的复合物MHC‑靶标肽复合物形式呈现的靶标肽。本发明提供了用于对潜在靶标肽进行排序以减轻脱靶毒性的计算系统和方法。此类计算系统和方法可以简化有效、耐受性良好的抗原识别分子的开发以治疗疾病。

主权项:1.一种非瞬态计算机可读介质,其被配置为与计算设备的一个或多个处理器通信,所述非瞬态计算机可读介质包括其上的指令,当由处理器执行时,所述指令使计算设备:a接收以与主要组织相容性复合体MHC分子的复合物MHC-靶标肽复合物形式呈现的靶标肽的计算表示作为输入;b确定靶标肽与MHC分子的结合亲和力;c生成多个突变肽的序列,每个突变肽与靶标肽的各自氨基酸位置处的突变相关;d确定多个突变肽中的每个突变肽与MHC分子的结合亲和力;e至少部分地基于每个突变肽的结合亲和力与靶标肽的结合亲和力的比较,预测参与与识别所述MHC-靶标肽复合物的抗原识别分子的相互作用的氨基酸位置;以及f提供可能参与与抗原识别分子的相互作用的氨基酸位置的指示作为输出。

全文数据:

权利要求:

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