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一种用于miRNA检测的探针及其检测方法和应用 

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申请/专利权人:海南医学院

摘要:本发明公开了一种用于miRNA检测的探针及其检测方法和应用,涉及检测技术领域。所述探针包括挂锁探针、SERS探针和含有DNA的磁球@ZIP链,所述挂锁探针能特异性结合miRNA、SERS探针和磁球@ZIP链,包括:目标识别位点:包括位于挂锁探针长链两端的核苷酸序列D1和核苷酸序列D2,所述D1和D2能与待检测的miRNA完全互补地结合,且在T4DNA连接酶的作用下形成一个圆形结构;SERS探针连接子:为与序列D1和D2相连的P区域,用于SERS探针的识别和富集;磁珠连接子:分别与两端的SERS探针连接子P连接,其核苷酸序列与磁球@ZIP链上的DNA序列互补。本发明结合了等温扩增技术和拉曼散射技术,通过设计特殊探针并实现信号的放大,能够提高miRNA检测的灵敏度,减少对患者的损伤和并发症产生的几率。

主权项:1.一种检测miRNA的方法,其特征在于,所述方法为非诊断目的,包括如下步骤:进行滚环扩增反应,向反应管中加入待检测的miRNA、挂锁探针、DNA连接酶和反应缓冲液,以miRNA作为引物,与挂锁探针相互作用成环,然后将成环产物作为模板,加入含有DNA的磁球@ZIP链作为引物,加入dNTP、Phi29DNA聚合酶、DTT和反应缓冲液,混合均匀,产生含有待检测的miRNA片段的长链产物磁球@RCA;向磁球@RCA中加入DNA-AuNP结合物,混合反应,得到磁球@RCA@AuNP复合物;通过磁球@RCA@AuNP复合物对SERS探针进行识别和富集,检测上清液中SERS的信号强度;所述挂锁探针能特异性结合miRNA、SERS探针和含有DNA的磁球@ZIP链,挂锁探针具有D1-P-zip-P-D2模式结构,且所述挂锁探针序列不形成稳定的二级结构,包括:目标识别位点:所述目标识别位点包括位于挂锁探针两端的核苷酸序列D1和核苷酸序列D2,所述D1和D2能与待检测的miRNA完全互补地结合,且在T4DNA连接酶的作用下形成一个圆形结构;SERS探针连接子:所述SERS探针连接子为与序列D1和D2相连的P区域,所述SERS探针连接子用于SERS探针的识别和富集;磁珠连接子:所述磁珠连接子zip两端分别与两端的SERS探针连接子P连接,所述磁珠连接子zip的核苷酸序列与磁球@ZIP链上的DNA序列互补,使其能够被磁珠识别连接;所述SERS探针的制备方法包括如下步骤:采用“金种子生成法”制备金纳米颗粒AuNPs溶液,用拉曼报告分子孔雀石绿异硫氰酸酯MGITC修饰金纳米颗粒AuNPs,得到SERS探针AuNP@MGITC;所述含有DNA的磁球@ZIP链制备方法包括如下步骤:重悬链霉亲和素磁珠,分离去除上清,洗涤,用BindingWashingBufferI重悬磁珠,加入生物素标记核酸样品,充分振荡混悬,室温孵育,然后分离去除上清,继续用BindingWashingBufferI重悬磁珠,得到含有DNA的磁球@ZIP链;DNA-AuNP结合物采用如下方法制备:将金纳米颗粒AuNPs溶液与巯基修饰的DNA混合,微波加热反应,用PBS磷酸盐重悬缓冲液,然后用磷酸盐缓冲液洗涤颗粒,离心得到沉淀,将所述沉淀重悬于PBS缓冲液中,得到DNA-AuNP结合物,所述巯基修饰的DNA与所述挂锁探针的SERS探针连接子P区域的核苷酸序列相同。

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