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预测肿瘤特异性抗原的计算方法 

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申请/专利权人:劲风生物技术(天津)有限公司

摘要:本发明公开了预测肿瘤特异性抗原的计算方法,涉及肿瘤治疗及诊断领域,本发明具体包括以下步骤:步骤一:分析二代测序数据;步骤二:分析并预测肿瘤特异性突变;步骤三:使用深度学习框架预测肿瘤特异性抗原;步骤四:使用机器学习框架归纳整合并排序肿瘤特异性抗原的免疫原性。本发明预测肿瘤特异性抗原的计算方法,首次使用多任务学习框架测肿瘤特异抗原呈递性,并改进损失函数平衡不同任务的权重,改进梯度更新方向优化不同任务的效果,及改进数据增强方式平衡标签类别,从而提高预测算法的准确性及新颖性,体现了本发明的创新性。另外,使用机器学习模型整合不同维度肿瘤特异抗原呈递性的信息,使用统计学方法高效整合多重信息预测肿瘤特异抗原免疫原性,保证肿瘤特异性抗原在预测结果中的完整性。

主权项:1.预测肿瘤特异性抗原的计算方法,其特征在于,具体包括以下步骤:步骤一:分析二代测序数据;步骤二:分析并预测肿瘤特异性突变;步骤三:使用深度学习框架预测肿瘤特异性抗原;步骤四:使用机器学习框架归纳整合并排序肿瘤特异性抗原的免疫原性。

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