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申请/专利权人:深圳湾实验室
摘要:本公开提供了由机器执行的获得癌症风险预测标志物的方法、癌症风险评估方法、电子设备以及存储介质。获得癌症风险预测标志物的方法包括:分析受试者的生物样本的多个外周血循环游离DNAcfDNA片段以获得序列读数;获取血细胞核小体分布数据,并且确定核小体中心位置的上下游预定区间作为核小体保护区域;从多个cfDNA片段的序列读数中筛选出末端位于核小体保护区域中的部分cfDNA片段的序列读数;计算多个cfDNA片段的序列读数中的第一片段化特征,以及计算筛选出的部分cfDNA片段的序列读数中的第二片段化特征;以及计算第二片段化特征相对于第一片段化特征的变化水平的一个或多个差异值作为癌症风险预测标志物。
主权项:1.一种由机器执行的获得癌症风险预测标志物的方法,包括:分析受试者的生物样本的多个外周血循环游离DNAcfDNA片段以获得序列读数,所述序列读数包括指示所述多个cfDNA片段中的每个cfDNA片段的末端在基因组上的位置的末端位点信息;获取血细胞核小体分布数据,并且确定核小体中心位置的上下游预定区间作为核小体保护区域;对所述多个cfDNA片段执行片段筛选,以便从所述多个cfDNA片段的序列读数中筛选出末端位于所述核小体保护区域中的部分cfDNA片段的序列读数;计算所述多个cfDNA片段的序列读数中的第一片段化特征,以及计算筛选出的部分cfDNA片段的序列读数中的第二片段化特征;以及计算指示筛选出的部分cfDNA片段的第二片段化特征相对于所述多个cfDNA片段的第一片段化特征的变化水平的一个或多个差异值作为所述癌症风险预测标志物。
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权利要求:
百度查询: 深圳湾实验室 获得癌症风险预测标志物的方法以及癌症风险评估方法
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