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申请/专利权人：广西壮族自治区亚热带作物研究所(广西亚热带农产品加工研究所)
摘要：本发明提供蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法，属于生物信息分析领域，所述方法包括如下步骤：采用双向最佳比对的方法对蕉麻和芭蕉进行基因同源比对分析，进行差异基因表达分析，然后差异表达基因筛选，差异表达基因可视化处理，差异表达基因模式聚类处理，差异表达基因GO功能注释，差异表达基因KEGG通路注释，进行差异表达基因功能与通路的富集分析，差异表达基因IPATH分析，差异表达基因基于GO的GSEA分析，差异表达基因基于KEGG的GSEA分析。通过差异基因KEGG富集分析发现，DEGs显著富集在次生代谢物的生物合成、代谢途径、内质网中的蛋白质加工、内吞作用、泛素介导的蛋白水解等途径与细胞壁建成和纤维细胞发育密切相关。
主权项：1.蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法，其特征在于：所述方法包括如下步骤：步骤1：采用双向最佳比对的方法对蕉麻和芭蕉进行基因同源比对分析；步骤2：进行差异基因表达分析，然后差异表达基因筛选；步骤3：差异表达基因可视化处理，通过对筛选出的差异表达基因进行火山图和散点图的可视化作图，可以推断差异基因的整体分布情况；步骤4：差异表达基因模式聚类处理；步骤5：差异表达基因GO功能注释；步骤6：差异表达基因KEGG通路注释；步骤7：进行差异表达基因功能与通路的富集分析；步骤8：差异表达基因IPATH分析；步骤9：差异表达基因基于GO的GSEA分析；步骤10：差异表达基因基于KEGG的GSEA分析。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 广西壮族自治区亚热带作物研究所(广西亚热带农产品加工研究所) 蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法
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