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一种检测融合基因及其变体的系统以及方法和应用 

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申请/专利权人:重庆大学

摘要:本发明涉及疾病基因检测技术领域,具体涉及一种检测融合基因及其变体的系统以及方法和应用。一种检测融合基因及其变体的系统,包括识别切割单元和链置换单元;所述识别切割单元包括Cas13aRNA酶、用于识别融合基因的引导RNA和触发RNA;所述链置换单元包括探针H1和探针H2。本技术方案解决了现有技术中缺少能够简单快速检测融合基因及其变体的系统以及方法的技术问题。本方案可在1小时内完成肺癌患者EML4‑ALK融合变异的灵敏可靠的检测;在RNA总量为10ng时,检测低至0.5%的突变分子,最低检测浓度可达10‑4ngμL,适用于临床标本的测定等,能成为具有实际临床应用价值的检测手段。

主权项:1.一种检测EML4-ALK融合基因变体的系统,其特征在于,包括识别切割单元和链置换单元;所述识别切割单元包括Cas13aRNA酶、用于识别融合基因RNA的引导RNA和触发RNA;引导RNA的序列如SEQIDNO.2、SEQIDNO.6-SEQIDNO.11中任意一种所示;触发RNA的序列如SEQIDNO.3所示;所述链置换单元包括探针H1和探针H2;探针H1的序列如SEQIDNO.4所示,探针H1第8位的T上修饰有FAM荧光基团,3’末端修饰有Dabcyl基团;探针H2的序列如SEQIDNO.5所示;探针H2的第10位的C和第11位的T均为肽核酸;所述EML4-ALK融合基因变体包括突变位点序列如SEQIDNO.1所示的变体V1、突变位点序列如SEQIDNO.12所示的变体V2、突变位点序列如SEQIDNO.13所示的变体V3a、突变位点序列如SEQIDNO.14所示的变体V3b、突变位点序列如SEQIDNO.15所示的变体V4、突变位点序列如SEQIDNO.16所示的变体V5a和突变位点序列如SEQIDNO.17所示的变体V5b。

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