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长日照抑制基因变异在培育栽培稻中的应用 

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申请/专利权人:中国农业科学院作物科学研究所

摘要:本发明公开了长日照抑制基因变异在培育栽培稻中的应用。本发明提供了长日照抑制基因变异在检测或辅助检测待测栽培稻是否来源于高纬度稻作区中的应用;本发明证实栽培稻DTH8、DTH7、Ghd7、Hd1、PhyB和OsCOL4这6个基因groupA中的单倍型分别都与栽培稻早花期关联,groupB中单倍型分别都与晚花期单倍型关联。本发明证实当栽培稻4个或4个以上长日照抑制基因属于groupA中的单倍型时,则这一类栽培稻主要分布在30°N以北的稻作区,这对栽培稻的区域性育种具有理论指导意义。

主权项:1.检测DTH8、DTH7、Ghd7、Hd1、PhyB和OsCOL4基因的单倍型类型的物质在检测或辅助检测长日照条件下培育的待测栽培稻是否来源于高纬度稻作区中的应用;或,检测DTH8、DTH7、Ghd7、Hd1、PhyB和OsCOL4基因的单倍型类型的物质在制备检测或辅助检测长日照条件下培育的待测栽培稻是否来源于高纬度稻作区的产品中的应用;各个基因单倍型类型包括各个基因groupA单倍型和各个基因groupB单倍型;所述DTH8基因groupA单倍型为符合如下情况的DTH8基因:编码区中第56位为T、第74为A、第96位为T、第256位为T、306为A、第461位为A、第539-541位缺失、第569位为A、第651位为C、第659位为A和第893位为A;所述DTH8基因groupB单倍型为符合如下情况的DTH8基因:编码区中第56位为C、第74为C、第96位为G、第256位为G、306为C、第461位为C、第539-541位为GCG、第569位为C、第651位为T、第659位为C和第893位为G;所述Ghd7基因groupA单倍型为符合如下情况的Ghd7基因:编码区中第368位为A、第409为G、第527位为A、第703位为C;所述Ghd7基因groupB单倍型为符合如下情况的Ghd7基因:编码区中第368位为G、第409为A、第527位为T、第703位为G;所述Hd1基因groupA单倍型为符合如下情况的Hd1基因:编码区中第251-252位为AA、第443为G、第469位为A、第472位为A、490为A、第1215位为C、第1477位为A;所述Hd1基因groupB单倍型为符合如下情况的Hd1基因:编码区中第251-252位为GC、第443为A、第469位为C、第472位为C、490为G、第1215位为A、第1477位为G;所述OsCOL4基因groupA单倍型为符合如下情况的OsCOL4基因:编码区中第385位为C、第438为T、第733位为T;所述OsCOL4基因groupB单倍型为符合如下情况的OsCOL4基因:编码区中第385位为A、第438为C、第733位为G;所述DTH7基因groupA单倍型为符合如下情况的DTH7基因:编码区中第125位为T、第204为T、第641位为A、第1147位为G、1266为C、第1369位为A、第1385位T;所述DTH7基因groupB单倍型为符合如下情况的DTH7基因:编码区中第125位为C、第204为G、第641位为G、第1147位为A、1266为T、第1369位为G、第1385位为C;所述phyB基因groupA单倍型为符合如下情况的phyB基因:编码区中第282位为G、第525为C、第808位为T、第899位为A、1183为T、第1606位为C、第1638位T、第1833位为G;所述phyB基因groupB单倍型为符合如下情况的phyB基因:编码区中第282位为C、第525为T、第808位为C、第899位为G、1183为G、第1606位为T、第1638位为C、第1833位为A;所述DTH8基因的RAP-DB编号是Os08g0174500;所述Ghd7基因的RAP-DB编号是Os07g0261200;所述Hd1基因的RAP-DB编号是Os06g0275000;所述OsCOL4基因的RAP-DB编号是Os02g0610500;所述DTH7基因的RAP-DB编号是Os07g0695100;所述phyB基因的RAP-DB编号是Os03g0309200;所述检测DTH8、DTH7、Ghd7、Hd1、PhyB和OsCOL4基因的单倍型类型的物质包括分别用于扩增DTH8、DTH7、Ghd7、Hd1、PhyB和OsCOL4基因的引物。

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