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一种具核梭杆菌的亚种检测和鉴定方法 

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申请/专利权人:上海市第十人民医院

摘要:本发明涉及生物医药技术领域,具体涉及一种具核梭杆菌的亚种检测和鉴定方法。具核梭杆菌与多种疾病密切关联,近期研究表明其可促进结直肠肿瘤发生发展。但目前还缺乏一种精确、直观的检测方法用来区别具核梭杆菌的不同亚种。具核梭杆菌不同亚种在生物学特性、定植及致病能力上均存在差异,因此精确的亚种鉴定对于了解其致病机制具有深远意义。本发明提供了一组用于鉴定具核梭杆菌亚种的特异性DNA序列,并设计了相应的检测引物,阐述了其在亚种水平检测和鉴定具核梭杆菌的应用。该发明可促进揭示病灶中具核梭杆菌的亚种构成及来源,将有助于探究不同亚种与疾病间的关系,及相关流行病学特征。

主权项:1.一组特异性DNA序列在检测和鉴定具核梭杆菌亚种中的应用,其特征在于,所述应用不包括疾病的诊断与治疗用途,所述特异性DNA序列包括:1SR-n1、SR-n2、SR-n3、SR-n4、SR-n5、SR-n6中的至少一种;和2SR-a1;和3SR-v1;和4SR-p1与SR-p2或SR-p3的组合;所述SR-n1的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示;所述SR-n2的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示;所述SR-n3的核苷酸序列如SEQIDNO.3所示;所述SR-n4的核苷酸序列如SEQIDNO.4所示;所述SR-n5的核苷酸序列如SEQIDNO.5所示;所述SR-n6的核苷酸序列如SEQIDNO.6所示;所述SR-a1的核苷酸序列如SEQIDNO.7所示;所述SR-v1的核苷酸序列如SEQIDNO.8所示;所述SR-p1的核苷酸序列如SEQIDNO.9所示;所述SR-p2的核苷酸序列如SEQIDNO.10所示;所述SR-p3的核苷酸序列如SEQIDNO.11所示;或所述SR-n1、SR-n2、SR-n3、SR-n4、SR-n5、SR-n6、SR-a1、SR-v1、SR-p1、SR-p2、SR-p3的核苷酸序列为与相应的SEQIDNO.1~11所示核苷酸序列具有85-99%相似性的同源序列;所述特异性DNA序列检测单一菌株样本的准确度为100%。

全文数据:

权利要求:

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