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申请/专利权人：中国农业科学院棉花研究所;三亚中国农业科学院国家南繁研究院

摘要：本发明公开了一种利用特异等位变异组合鉴定长绒棉的方法，属于分子生物学领域。本发明公开了一种SSR引物组合在鉴定长绒棉中的应用，所述SSR引物组合为能扩增出长绒棉特异等位变异片段的SSR引物，其核苷酸序列依次如SEQIDNO：1‑40所示。本发明对1572个细绒棉标准样品和46个长绒棉标准样品进行研究，发现20种等位变异只存在于长绒棉品种中，以此利用扩增这20种等位变异的SSR引物组合检测棉纺纱线是否含有长绒棉，本发明为长绒棉纺织的纱线检测提供了鉴定方法，保障纺织企业购买到货真价实的长绒棉纱线，有利于市场上长绒棉产品的推广。

主权项：1.一种SSR引物组合在鉴定长绒棉中的应用，其特征在于，所述SSR引物组合为能扩增出长绒棉特异等位变异片段的SSR引物组合，由PW03、PW09、PW30、PW60、PW19、PW54、PW36、PW38、PW59、PW27、PW24、PW13、PW58、PW52、PW55、PW12、PW20、PW02、PW35和PW10引物组成；其中，PW03引物的正向引物序列如SEQIDNO：1所示，反向引物序列如SEQIDNO：2所示；PW03引物扩增得到175bp长绒棉特异等位变异片段；PW09引物的正向引物序列如SEQIDNO：3所示，反向引物序列如SEQIDNO：4所示；PW09引物扩增得到208bp长绒棉特异等位变异片段；PW30引物的正向引物序列如SEQIDNO：5所示，反向引物序列如SEQIDNO：6所示；PW30引物扩增得到213bp长绒棉特异等位变异片段；PW60引物的正向引物序列如SEQIDNO：7所示，反向引物序列如SEQIDNO：8所示；PW60引物扩增得到219bp长绒棉特异等位变异片段；PW19引物的正向引物序列如SEQIDNO：9所示，反向引物序列如SEQIDNO：10所示；PW19引物扩增得到231bp长绒棉特异等位变异片段；PW54引物的正向引物序列如SEQIDNO：11所示，反向引物序列如SEQIDNO：12所示；PW54引物扩增得到244bp长绒棉特异等位变异片段；PW36引物的正向引物序列如SEQIDNO：13所示，反向引物序列如SEQIDNO：14所示；PW36引物扩增得到258bp长绒棉特异等位变异片段；PW38引物的正向引物序列如SEQIDNO：15所示，反向引物序列如SEQIDNO：16所示；PW38引物扩增得到290bp长绒棉特异等位变异片段；PW59引物的正向引物序列如SEQIDNO：17所示，反向引物序列如SEQIDNO：18所示；PW59引物扩增得到298bp长绒棉特异等位变异片段；PW27引物的正向引物序列如SEQIDNO：19所示，反向引物序列如SEQIDNO：20所示；PW27引物扩增得到335bp长绒棉特异等位变异片段；PW24引物的正向引物序列如SEQIDNO：21所示，反向引物序列如SEQIDNO：22所示；PW24引物扩增得到205bp长绒棉特异等位变异片段；PW13引物的正向引物序列如SEQIDNO：23所示，反向引物序列如SEQIDNO：24所示；PW13引物扩增得到210bp长绒棉特异等位变异片段；PW58引物的正向引物序列如SEQIDNO：25所示，反向引物序列如SEQIDNO：26所示；PW58引物扩增得到219bp长绒棉特异等位变异片段；PW52引物的正向引物序列如SEQIDNO：27所示，反向引物序列如SEQIDNO：28所示；PW52引物扩增得到243bp长绒棉特异等位变异片段；PW55引物的正向引物序列如SEQIDNO：29所示，反向引物序列如SEQIDNO：30所示；PW55引物扩增得到260bp长绒棉特异等位变异片段；PW12引物的正向引物序列如SEQIDNO：31所示，反向引物序列如SEQIDNO：32所示；PW12引物扩增得到293bp长绒棉特异等位变异片段；PW20引物的正向引物序列如SEQIDNO：33所示，反向引物序列如SEQIDNO：34所示；PW20引物扩增得到306bp长绒棉特异等位变异片段；PW02引物的正向引物序列如SEQIDNO：35所示，反向引物序列如SEQIDNO：36所示；PW02引物扩增得到281bp长绒棉特异等位变异片段；PW35引物的正向引物序列如SEQIDNO：37所示，反向引物序列如SEQIDNO：38所示；PW35引物扩增得到343bp长绒棉特异等位变异片段；PW10引物的正向引物序列如SEQIDNO：39所示，反向引物序列如SEQIDNO：40所示；PW10引物扩增得到361bp长绒棉特异等位变异片段。

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