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一种基于纳米孔测序芯片的DNA数据存储方法 

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申请/专利权人:南方科技大学

摘要:本发明提供了一种基于纳米孔测序芯片的DNA数据存储方法,涉及DNA数据存储技术领域,包括有效载荷、引物序列、条形码序列和若干个均匀分布于有效载荷上的锚定序列;引物序列用于启动复合核酸分子的复制或扩增;条形码序列用于识别和追踪不同的DNA特异性序列;有效载荷用于承载拟存储数据的DNA序列;锚定序列用于过滤数据、重定位和扩充条形码序列空间大小。能够精准过滤纳米孔测序得到的长度200bp的测序读段中的高插入和删除错误,提高准确性,解决了现有技术中方法无法对应用于高纳米孔测序的长度200bp的测序读段中的高插入和删除错误进行有效处理的技术问题。

主权项:1.一种基于纳米孔测序芯片的DNA数据存储方法,其特征在于,包括以下步骤:A、对拟存储数据进行复合字母编码生成有效载荷;B、将条形码和锚定序列分别整合至步骤A生成的有效载荷得到复合核酸分子;C、通过纳米孔测序芯片对复合核酸分子进行测序,得到纳米孔测序数据,将纳米孔测序数据与复合核酸分子的碱基序列进行比对、过滤、对齐组装得到共识序列;D、对共识序列进行解码得到拟存储数据;所述C包括:C-1、将纳米孔测序数据分别与若干个复合核酸分子的碱基序列中的条形码序列进行比对,得到若干个条形码组;C-2、根据上游引物和下游引物在各纳米孔测序数据中位置之间的核苷酸序列长度及锚定序列在各纳米孔测序数据中的位置,对各条形码组的纳米孔测序数据进行过滤处理;C-3、对步骤C-2过滤处理后的条形码组进行聚类,并按照类内序列量进行排序,选择位于前M个的类进行多序列对齐,组装得到共识序列。

全文数据:

权利要求:

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