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申请/专利权人：常州机电职业技术学院
摘要：本发明涉及吸附构型技术领域，尤其涉及一种氧化石墨烯与DNA分子相互作用的动力学分析方法，包括构建不同氧化程度的GO结构模型，氧化程度分别为0％、5％、10％、15％、20％和25％，环氧基团和羟基基团的比例1:1；构建DNA和GO吸附体系初始模型；对吸附体系初始模型进行体系能量最小化处理，得到能量最小化体系；对DNA分子施加位置约束，进行预平衡模拟；进行分子动力学模拟，得到快照和轨迹；根据作用结果快照和轨迹，获得吸附体系及分子结构变化，并计算吸附体系各物质在模拟过程动力学信息。本发明通过分子动力学方法来研究DNA分子在不同氧化程度GO上的吸附过程，寻找稳定吸附构型。
主权项：1.一种氧化石墨烯与DNA分子相互作用的动力学分析方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤一、基于Shi-Tu模型构建不同氧化程度的GO结构模型，不同氧化程度上GO的碳原子数相同；氧化程度分别为0％、5％、10％、15％、20％和25％，环氧基团和羟基基团的比例1:1，两者数量偏差±8％；步骤二、利用AMBER软件构建DNA分子结构，构建DNA和GO吸附体系初始模型，将模拟周期性盒子充满水溶剂，将其中阈值数量的水分子替换为等数量钠离子使得模拟体系成电中性；步骤三、采用steep最陡下降法和cg共轭梯度法对吸附体系初始模型进行体系能量最小化处理，得到能量最小化体系；步骤四、对DNA分子施加位置约束，进行预平衡模拟；步骤五、进行分子动力学模拟，得到快照和轨迹；步骤六、根据作用结果快照和轨迹，获得吸附体系及分子结构变化，并计算吸附体系各物质在模拟过程动力学信息。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 常州机电职业技术学院 一种氧化石墨烯与DNA分子相互作用的动力学分析方法
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