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申请/专利权人:劲风生物技术(天津)有限公司
摘要:本发明公开了一种肿瘤新抗原的筛选方法,应用在肿瘤治疗及诊断技术领域,本发明通过设置通过获取潜在抗原的多肽集合,以及根据HLA分型在人群中的频率获取高频的HLA分型集合,并将两者亲和力预测以及进行分子对接打分,方便后续进一步的根据所述候选多肽序列进行针对性的实验,操作简单,以及通过述荧光报告基团和所述荧光淬灭基团用于修饰与肿瘤患者样本的HLA基因型和候选抗原突变位点所在序列对应的氨基酸序列;用该载体培养肿瘤患者样本的PBMC后,即可根据荧光信号筛选肿瘤新抗原,可高通量检测多个候选的多肽序列,已达到批量筛选肿瘤新抗原的目的,大大的减少实验的次数,实现省时、省力且增加筛选精准度的效果。
主权项:1.一种肿瘤新抗原的筛选方法,其特征在于:包括如下几个步骤:A:获取肿瘤组织细胞的突变基因所对应编码的各个多肽序列,并将其作为潜在抗原的多肽集合;B;获取各个HLA分型在人群中的频率并据此获取频率超过指定阈值的HLA分型集合;并将所述多肽集合中的多肽序列与所述HLA分型集合中的HLA分型分别进行亲和力预测,并筛选出亲和力超过指定阈值的多肽序;C:将超过指定阈值的多肽序进行分子对接,然后将所述分子对接的打分值中超过指定阈值时对应的多肽序列作为肿瘤新抗原的候选多肽序列;D:用荧光报告基团和荧光淬灭基团将所述候选的多肽序列进行修饰,然后固定在载体上;E:获取所述样本的PBMC,将固定有所述候选多肽序列的载体置于所述PBMC中进行细胞培养;F:待所述细胞培养结束后,检测所述载体上的荧光信号,根据所述荧光信号筛选出肿瘤新抗原:所述载体上的阳性发光区域对应的候选多肽序列即为所述肿瘤新抗原。
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